More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4640 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
719 aa  1434    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  40.9 
 
 
787 aa  523  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  38.65 
 
 
724 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  36.06 
 
 
840 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  35.07 
 
 
825 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  36.56 
 
 
826 aa  347  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  33.98 
 
 
703 aa  344  4e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  34.01 
 
 
812 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  34.4 
 
 
722 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  34.27 
 
 
830 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  36.47 
 
 
821 aa  335  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  34.75 
 
 
824 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  34.76 
 
 
713 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  34.81 
 
 
720 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  33.42 
 
 
722 aa  328  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.55 
 
 
825 aa  326  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0569  TonB-dependent siderophore receptor  32.53 
 
 
724 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  33.56 
 
 
802 aa  324  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0580  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 
725 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0535  TonB-dependent siderophore receptor  32.33 
 
 
725 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  34.41 
 
 
745 aa  320  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 
738 aa  319  9e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 
738 aa  319  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 
727 aa  319  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  33.99 
 
 
803 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0586  TonB-dependent siderophore receptor  31.6 
 
 
724 aa  317  5e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  33.01 
 
 
717 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  34.13 
 
 
747 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  33.42 
 
 
724 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  32.18 
 
 
831 aa  313  5.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  33.42 
 
 
809 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  34.97 
 
 
752 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  35.12 
 
 
719 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  35.12 
 
 
719 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  35.6 
 
 
841 aa  310  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  32.23 
 
 
841 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  32.71 
 
 
816 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 
814 aa  308  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 
828 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  31.69 
 
 
806 aa  305  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  31.49 
 
 
844 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  31.98 
 
 
841 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  32.69 
 
 
841 aa  303  7.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  33.84 
 
 
828 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 
836 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  33.1 
 
 
822 aa  299  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  31.66 
 
 
799 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  32.29 
 
 
822 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 
746 aa  297  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 
795 aa  295  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 
819 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  30.77 
 
 
815 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  31.28 
 
 
826 aa  293  8e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.35 
 
 
743 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2539  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 
719 aa  289  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  31.42 
 
 
817 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  30.31 
 
 
798 aa  287  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  32.73 
 
 
800 aa  287  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  31.39 
 
 
808 aa  286  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  31.11 
 
 
812 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  31.31 
 
 
810 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 
840 aa  284  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  29.62 
 
 
807 aa  284  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  32.91 
 
 
723 aa  280  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  30.91 
 
 
789 aa  279  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  32.61 
 
 
803 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 
833 aa  273  9e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 
732 aa  272  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 
827 aa  272  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 
730 aa  268  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  29.05 
 
 
744 aa  268  2.9999999999999995e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 
802 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  30.08 
 
 
753 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  30.69 
 
 
766 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  30.08 
 
 
753 aa  261  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 
801 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 
765 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  30.82 
 
 
864 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 
765 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  30.17 
 
 
765 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 
740 aa  251  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 
723 aa  247  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 
803 aa  246  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 
748 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  28.95 
 
 
699 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0540  TonB-dependent siderophore receptor  31.27 
 
 
718 aa  241  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.85 
 
 
747 aa  240  6.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  30.2 
 
 
714 aa  238  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 
741 aa  238  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0603  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 
716 aa  238  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00298801  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.62 
 
 
724 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.62 
 
 
724 aa  235  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.48 
 
 
724 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.32 
 
 
724 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0114  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 
728 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.34 
 
 
724 aa  230  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4426  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 
728 aa  230  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  30.69 
 
 
735 aa  229  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4286  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 
728 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3097  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 
723 aa  229  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582192  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>