More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0814 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  49.5 
 
 		 971 aa  669    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  60.03 
 
 		 720 aa  745    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  60.4 
 
 		 686 aa  739    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  49.37 
 
 		 927 aa  813    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  60.07 
 
 		 686 aa  735    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  59.9 
 
 		 686 aa  735    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  60.07 
 
 		 686 aa  736    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  60.07 
 
 		 686 aa  736    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  44.33 
 
 		 845 aa  665    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  59.52 
 
 		 705 aa  736    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  56.59 
 
 		 860 aa  694    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  54.23 
 
 		 692 aa  638    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  53.43 
 
 		 985 aa  680    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  59.52 
 
 		 705 aa  736    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  59.9 
 
 		 686 aa  735    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  40.82 
 
 		 882 aa  656    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  48.84 
 
 		 903 aa  656    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  71.29 
 
 		 752 aa  905    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  62.99 
 
 		 739 aa  780    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  60.4 
 
 		 686 aa  739    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  51.67 
 
 		 822 aa  635    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  56.89 
 
 		 1035 aa  638    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  59.73 
 
 		 688 aa  735    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  40.9 
 
 		 882 aa  657    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  63.45 
 
 		 732 aa  783    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0817  translation initiation factor IF-2  61.29 
 
 		 950 aa  750    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  62.46 
 
 		 829 aa  788    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 882 aa  1794    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  66.18 
 
 		 834 aa  834    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  48.45 
 
 		 943 aa  806    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  59.76 
 
 		 688 aa  733    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  54.95 
 
 		 1161 aa  659    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  49.08 
 
 		 1029 aa  644    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  60.4 
 
 		 689 aa  735    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  53.01 
 
 		 883 aa  633  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  47.45 
 
 		 947 aa  634  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  52.16 
 
 		 986 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  53.23 
 
 		 879 aa  629  1e-179  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  52.33 
 
 		 980 aa  630  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  49.27 
 
 		 888 aa  624  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  51.85 
 
 		 920 aa  624  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  53.31 
 
 		 686 aa  625  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  54.39 
 
 		 1079 aa  623  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  50.3 
 
 		 896 aa  620  1e-176  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  48.91 
 
 		 949 aa  618  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  51.73 
 
 		 997 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  51.89 
 
 		 921 aa  615  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  46.88 
 
 		 907 aa  610  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  51.04 
 
 		 679 aa  612  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  51.04 
 
 		 679 aa  612  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  52.5 
 
 		 924 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  54.66 
 
 		 1131 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  54.4 
 
 		 1079 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  51.66 
 
 		 984 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  49.76 
 
 		 673 aa  602  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  48.57 
 
 		 962 aa  604  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  50.24 
 
 		 922 aa  599  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  49.1 
 
 		 940 aa  600  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  49.03 
 
 		 904 aa  595  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  47.38 
 
 		 898 aa  596  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  51.98 
 
 		 949 aa  595  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  53.11 
 
 		 929 aa  595  1e-168  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  50.8 
 
 		 1116 aa  595  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  47.57 
 
 		 880 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  47.57 
 
 		 880 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  47.57 
 
 		 880 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  51.55 
 
 		 689 aa  590  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  47.57 
 
 		 880 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  51.02 
 
 		 738 aa  589  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  51.13 
 
 		 854 aa  590  1e-167  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  48.15 
 
 		 885 aa  585  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  49 
 
 		 891 aa  588  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  49.02 
 
 		 892 aa  588  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  47.71 
 
 		 876 aa  588  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  48.61 
 
 		 964 aa  588  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 943 aa  588  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  48.61 
 
 		 964 aa  588  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  47.99 
 
 		 885 aa  586  1e-166  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  51.35 
 
 		 879 aa  586  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 943 aa  587  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  46.3 
 
 		 968 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  50.51 
 
 		 975 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  48.63 
 
 		 964 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  50.51 
 
 		 975 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  49.35 
 
 		 971 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 		 895 aa  584  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  52.14 
 
 		 941 aa  583  1.0000000000000001e-165  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 		 989 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  50.51 
 
 		 975 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  50.17 
 
 		 1011 aa  584  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  49.35 
 
 		 971 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  45.75 
 
 		 905 aa  584  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 729 aa  583  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  46.52 
 
 		 881 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  48.95 
 
 		 971 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  49.35 
 
 		 971 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  48.72 
 
 		 945 aa  584  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  49.58 
 
 		 894 aa  585  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  47.38 
 
 		 882 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  50.51 
 
 		 975 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>