281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4043 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4043  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 459 aa  830    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  45.9 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  40.4 
 
 		 414 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 397 aa  188  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  37.21 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.04 
 
 		 407 aa  154  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  33.24 
 
 		 402 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  31.28 
 
 		 414 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 409 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 408 aa  107  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  34.08 
 
 		 414 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 435 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 404 aa  97.1  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 399 aa  97.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 400 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 449 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 403 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  30.86 
 
 		 403 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 403 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  35.46 
 
 		 420 aa  88.2  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 431 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  34.27 
 
 		 530 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  30.25 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  40.34 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  31.31 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  27.04 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 272 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  33.68 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  30.71 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  34.48 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  36.36 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 474 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 		 492 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 		 410 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.26 
 
 		 527 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  36.63 
 
 		 499 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 480 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3312  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 503 aa  54.3  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.51 
 
 		 458 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  33.11 
 
 		 543 aa  53.9  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.74 
 
 		 410 aa  53.9  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  28.57 
 
 		 361 aa  53.5  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  51.11 
 
 		 1000 aa  53.1  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 504 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 497 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  32.6 
 
 		 497 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.16 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  34.85 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.79 
 
 		 409 aa  52  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.26 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.74 
 
 		 646 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  58.33 
 
 		 590 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  33.03 
 
 		 460 aa  51.2  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 574 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.74 
 
 		 646 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.74 
 
 		 646 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  33.56 
 
 		 490 aa  50.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.2 
 
 		 495 aa  50.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.39 
 
 		 428 aa  50.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.34 
 
 		 411 aa  50.8  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.34 
 
 		 411 aa  50.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 466 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.41 
 
 		 410 aa  50.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.2 
 
 		 521 aa  50.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 406 aa  50.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.37 
 
 		 565 aa  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3218  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 402 aa  50.1  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38 
 
 		 510 aa  50.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>