More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1255 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09900  transcription termination factor Rho  79.29 
 
 		 751 aa  641    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3935  transcription termination factor Rho  80.74 
 
 		 679 aa  647    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2421  transcription termination factor Rho  79.95 
 
 		 644 aa  639    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1651  transcription termination factor Rho  65.75 
 
 		 704 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271851  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1255  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 696 aa  1369    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.864478  normal  0.0460813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0886  transcription termination factor Rho  80.74 
 
 		 605 aa  647    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.562598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1058  transcription termination factor Rho  80.67 
 
 		 658 aa  632  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2462  transcription termination factor Rho  78.35 
 
 		 674 aa  624  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.683247  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0321  transcription termination factor Rho  77.31 
 
 		 662 aa  623  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4150  transcription termination factor Rho  78.63 
 
 		 747 aa  618  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2620  transcription termination factor Rho  75.51 
 
 		 729 aa  615  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0633  transcription termination factor Rho  76.64 
 
 		 676 aa  617  1e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0304997  decreased coverage  0.0015914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2098  transcription termination factor Rho  77.49 
 
 		 717 aa  615  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0421474  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6153  transcription termination factor Rho  74.48 
 
 		 709 aa  611  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.874638  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2353  transcription termination factor Rho  75.06 
 
 		 711 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000144518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3722  transcription termination factor Rho  74.55 
 
 		 698 aa  601  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.672937  normal  0.45086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1008  transcription termination factor Rho  74.03 
 
 		 670 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.588232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19310  transcription termination factor Rho  72.21 
 
 		 713 aa  592  1e-168  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650817  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1904  transcription termination factor Rho  73.58 
 
 		 662 aa  594  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  59.89 
 
 		 688 aa  590  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29930  transcription termination factor Rho  73.75 
 
 		 613 aa  591  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.660333 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3646  transcription termination factor Rho  74.8 
 
 		 675 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1747  transcription termination factor Rho  74.29 
 
 		 578 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.179757  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18390  transcription termination factor Rho  69.69 
 
 		 721 aa  582  1e-164  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.945824 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08060  transcription termination factor Rho  71.87 
 
 		 712 aa  581  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1301  transcription termination factor Rho  70.54 
 
 		 597 aa  575  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4345  transcription termination factor Rho  71.13 
 
 		 684 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3879  transcription termination factor Rho  71.02 
 
 		 663 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0110  transcription termination factor Rho  49.71 
 
 		 656 aa  571  1e-161  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3893  transcription termination factor Rho  71.02 
 
 		 663 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3967  transcription termination factor Rho  71.02 
 
 		 663 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.625424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11324  transcription termination factor Rho  70.34 
 
 		 602 aa  567  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.329237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2301  transcription termination factor Rho  71.09 
 
 		 691 aa  568  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1233  transcription termination factor Rho  68.02 
 
 		 653 aa  562  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1200  transcription termination factor Rho  70.73 
 
 		 689 aa  554  1e-156  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4746  transcription termination factor Rho  68.19 
 
 		 393 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1655  transcription termination factor Rho  59.64 
 
 		 498 aa  477  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.647483  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09300  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 638 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.270012 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  55.81 
 
 		 653 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1811  transcription termination factor Rho  62.18 
 
 		 594 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.186015  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  58.7 
 
 		 420 aa  465  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0407  transcription termination factor Rho  62.23 
 
 		 383 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  60.22 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  59.67 
 
 		 444 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  50.11 
 
 		 573 aa  459  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1088  transcription termination factor Rho  59.02 
 
 		 546 aa  459  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00846053  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  58.54 
 
 		 416 aa  456  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23670  transcription termination factor Rho  59.24 
 
 		 685 aa  454  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0108296  normal  0.784338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  59.08 
 
 		 415 aa  455  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  58.11 
 
 		 450 aa  452  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5202  transcription termination factor Rho  57.45 
 
 		 602 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  57.91 
 
 		 419 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  57.91 
 
 		 419 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  55.32 
 
 		 690 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2560  transcription termination factor Rho  57.69 
 
 		 406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.910753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  57.41 
 
 		 418 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  57.41 
 
 		 418 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  57.53 
 
 		 419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0264  transcription termination factor Rho  58.22 
 
 		 512 aa  449  1.0000000000000001e-124  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  55.95 
 
 		 436 aa  449  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  56.76 
 
 		 642 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0481  transcription termination factor Rho  57.75 
 
 		 420 aa  449  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  57.64 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01045  transcription termination factor Rho  50.24 
 
 		 579 aa  443  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  57.64 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  57.64 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  57.64 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0584  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 419 aa  445  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.290432  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  55.04 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1295  transcription termination factor Rho  55.12 
 
 		 750 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.623564 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3070  transcription termination factor Rho  57.45 
 
 		 615 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581675  hitchhiker  0.00476927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03661  transcription termination factor Rho  56.27 
 
 		 419 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000324277  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  55.14 
 
 		 548 aa  439  9.999999999999999e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  57.1 
 
 		 419 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  57.1 
 
 		 419 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  56.95 
 
 		 415 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  56.87 
 
 		 418 aa  440  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  56.87 
 
 		 418 aa  440  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  57.72 
 
 		 419 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  56.95 
 
 		 415 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03610  hypothetical protein  56.27 
 
 		 419 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000108874  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  56 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  56.99 
 
 		 492 aa  437  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  55.41 
 
 		 421 aa  438  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  57.45 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3953  transcription termination factor Rho  56.84 
 
 		 421 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  55.5 
 
 		 422 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3878  transcription termination factor Rho  56.84 
 
 		 421 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128755 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4003  transcription termination factor Rho  56 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.499603  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2158  transcription termination factor Rho  56.91 
 
 		 564 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.156319  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  54.26 
 
 		 422 aa  439  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4139  transcription termination factor Rho  56 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  56 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0188  transcription termination factor Rho  56.84 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5215  transcription termination factor Rho  56 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4220  transcription termination factor Rho  56 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00203599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  56.4 
 
 		 415 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4662  transcription termination factor Rho  55.23 
 
 		 604 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3217  transcription termination factor Rho  57.37 
 
 		 420 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  56.13 
 
 		 415 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>