More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2195 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 655 aa  1306    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 654 aa  192  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1704  histidine kinase  36.88 
 
 		 294 aa  178  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.318661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 587 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 663 aa  173  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 1042 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 438 aa  156  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0851  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 469 aa  154  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 1052 aa  154  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 657 aa  147  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 472 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.209845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 689 aa  135  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 1045 aa  134  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 748 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 579 aa  132  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.352979  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 603 aa  131  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 732 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  30.71 
 
 		 853 aa  127  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 563 aa  127  9e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1743  histidine kinase  35.63 
 
 		 559 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 1291 aa  122  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1265  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 807 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 594 aa  117  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 493 aa  115  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0919  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 404 aa  115  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000529164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  37.85 
 
 		 265 aa  115  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.39 
 
 		 859 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 1138 aa  113  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.76 
 
 		 572 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0318  putative PAS/PAC sensor protein  25.76 
 
 		 590 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375606  normal  0.106516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 1741 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3085  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.94 
 
 		 905 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 562 aa  111  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.98 
 
 		 853 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  34.35 
 
 		 582 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 991 aa  111  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2652  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.26 
 
 		 598 aa  110  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0285  putative PAS/PAC sensor protein  39.74 
 
 		 593 aa  110  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 		 1820 aa  110  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 		 830 aa  109  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  36.97 
 
 		 680 aa  108  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 779 aa  108  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0178  histidine kinase  38.29 
 
 		 557 aa  108  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.283442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  37.06 
 
 		 1589 aa  108  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0253  histidine kinase  34.04 
 
 		 588 aa  107  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1042  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.13 
 
 		 1059 aa  103  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.192885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1080  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 1128 aa  103  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.65 
 
 		 929 aa  103  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.968718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4032  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.36 
 
 		 1036 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.661545 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 1359 aa  103  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  27.6 
 
 		 754 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1135  putative signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 338 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.177976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.3 
 
 		 1215 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.98 
 
 		 1313 aa  102  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3503  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.02 
 
 		 1101 aa  101  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1570  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 383 aa  101  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.04 
 
 		 773 aa  101  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 511 aa  101  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0103276  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 734 aa  101  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0751397  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  21.81 
 
 		 797 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.68 
 
 		 959 aa  100  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  27.06 
 
 		 531 aa  100  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.57 
 
 		 1260 aa  100  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 884 aa  100  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 644 aa  100  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4262  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.64 
 
 		 861 aa  100  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3188  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 810 aa  99.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.98 
 
 		 773 aa  99.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.44 
 
 		 927 aa  99.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 578 aa  99  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 		 369 aa  99  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.55 
 
 		 973 aa  98.6  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0175  histidine kinase  35.4 
 
 		 322 aa  98.6  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0979792  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2389  histidine kinase  32.09 
 
 		 298 aa  98.6  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0317166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1021  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.85 
 
 		 1051 aa  98.2  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126981  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 478 aa  97.8  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.1 
 
 		 1260 aa  97.4  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 516 aa  97.8  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 		 858 aa  97.4  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.3 
 
 		 769 aa  96.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  38.17 
 
 		 723 aa  96.3  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 351 aa  96.3  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  27.04 
 
 		 684 aa  96.3  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0667  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.06 
 
 		 1036 aa  96.3  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  25.26 
 
 		 533 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 1146 aa  95.5  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  27.89 
 
 		 533 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2903  putative PAS/PAC sensor protein  34.71 
 
 		 400 aa  95.1  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.097748  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  40.32 
 
 		 580 aa  95.1  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  27.89 
 
 		 533 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  26.04 
 
 		 827 aa  94.7  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0391  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.51 
 
 		 1040 aa  95.1  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.519884  normal  0.119604 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  33.19 
 
 		 588 aa  94.4  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 1042 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.05 
 
 		 603 aa  92.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1716  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32 
 
 		 1238 aa  92  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 		 765 aa  92  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 364 aa  91.7  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>