151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0966 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0966  UspA domain protein  100 
 
 
150 aa  298  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0223  UspA domain protein  45.27 
 
 
148 aa  137  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.189341  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1304  UspA domain protein  50.34 
 
 
155 aa  135  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.708291  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1930  UspA domain protein  48.65 
 
 
149 aa  131  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110845  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3428  UspA domain protein  48.99 
 
 
153 aa  128  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  33.99 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  34.25 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  33.33 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  34.48 
 
 
180 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  34.9 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  31.76 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  32.21 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  33.33 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.08 
 
 
290 aa  54.3  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  30.56 
 
 
151 aa  53.9  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  33.55 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  31.41 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  28.67 
 
 
207 aa  52.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.56 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.03 
 
 
158 aa  52  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  30.52 
 
 
156 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  29.73 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  29.25 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  28.95 
 
 
153 aa  50.8  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  30.14 
 
 
280 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  29.17 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  26.85 
 
 
307 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  28.08 
 
 
151 aa  50.4  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  32.41 
 
 
145 aa  50.4  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  28.38 
 
 
301 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  29.25 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1334  UspA domain-containing protein  25 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000527962 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  29.25 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  29.66 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  30.82 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  30.61 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1666  UspA domain protein  30.6 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.189674  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2278  universal stress protein family  28.17 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000472572  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  27.4 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  30.82 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  28.57 
 
 
149 aa  48.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  27.7 
 
 
300 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  33.56 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  26.71 
 
 
169 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  27.94 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  31.39 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  30.14 
 
 
150 aa  47  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  28 
 
 
286 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2076  hypothetical protein  27.66 
 
 
164 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.969502  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  25.34 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  25 
 
 
140 aa  47  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  29.05 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  28.67 
 
 
208 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  26.03 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  30.77 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  26.85 
 
 
283 aa  45.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.38 
 
 
305 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  28.19 
 
 
320 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  26.53 
 
 
141 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  29.66 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  28.1 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  27.7 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  31.94 
 
 
183 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  25.66 
 
 
297 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  28.06 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  28.28 
 
 
294 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  32.14 
 
 
145 aa  44.3  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 
158 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  28.86 
 
 
152 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  25.34 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  27.4 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  26.21 
 
 
291 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  28.67 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  30.14 
 
 
289 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  26.67 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  30 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  26 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  27.4 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  26.32 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  26.03 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  23.87 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  26.32 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2851  hypothetical protein  28.32 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.130052  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  24.66 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  31.29 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01240  universal stress protein UspA-like protein  28.86 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  26.9 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  32.89 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>