More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5771 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  100 
 
 		 711 aa  1415    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  28.72 
 
 		 614 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3002  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 630 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398528 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  27.31 
 
 		 616 aa  164  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  32.53 
 
 		 513 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  25.15 
 
 		 669 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  31.64 
 
 		 513 aa  124  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  29.97 
 
 		 650 aa  123  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  32.93 
 
 		 513 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  31.33 
 
 		 513 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  26.03 
 
 		 588 aa  117  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.51 
 
 		 595 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  26.22 
 
 		 524 aa  115  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  24.31 
 
 		 601 aa  114  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  27.93 
 
 		 717 aa  110  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  28.41 
 
 		 530 aa  110  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  27.71 
 
 		 635 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  27.48 
 
 		 513 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  29.83 
 
 		 677 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.44 
 
 		 498 aa  109  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  27.27 
 
 		 637 aa  108  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  31.98 
 
 		 285 aa  108  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  30.37 
 
 		 481 aa  108  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  27.22 
 
 		 778 aa  107  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  27.56 
 
 		 501 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  28.29 
 
 		 514 aa  106  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  26.7 
 
 		 600 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  30.43 
 
 		 834 aa  106  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  30.62 
 
 		 398 aa  106  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  27.23 
 
 		 511 aa  105  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  32.11 
 
 		 405 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  25.94 
 
 		 365 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  29.25 
 
 		 437 aa  104  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  28.23 
 
 		 388 aa  104  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  27.82 
 
 		 466 aa  104  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  28.05 
 
 		 461 aa  103  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  21.12 
 
 		 526 aa  103  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  26.19 
 
 		 658 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  28.02 
 
 		 715 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  26.86 
 
 		 389 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  27.93 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  27.93 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  29.1 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  29.1 
 
 		 481 aa  102  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.93 
 
 		 389 aa  102  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  28.86 
 
 		 481 aa  102  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  29.91 
 
 		 490 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  29.1 
 
 		 481 aa  102  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  25.65 
 
 		 590 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.73 
 
 		 388 aa  101  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  27.93 
 
 		 388 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  29.46 
 
 		 610 aa  101  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  29.15 
 
 		 351 aa  101  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  28.14 
 
 		 388 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  23.77 
 
 		 544 aa  100  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  32.42 
 
 		 480 aa  100  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.53 
 
 		 484 aa  100  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.93 
 
 		 388 aa  100  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  27.8 
 
 		 483 aa  100  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  28.78 
 
 		 426 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  25.29 
 
 		 483 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  27.38 
 
 		 388 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  27.38 
 
 		 388 aa  99  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  32.57 
 
 		 362 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  23.97 
 
 		 803 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  28.85 
 
 		 450 aa  98.6  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  32.51 
 
 		 695 aa  98.2  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  23.16 
 
 		 399 aa  97.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  29.27 
 
 		 543 aa  97.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  29.27 
 
 		 543 aa  97.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  28.14 
 
 		 431 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  30.29 
 
 		 507 aa  97.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  31.84 
 
 		 539 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  27.01 
 
 		 559 aa  96.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  35.32 
 
 		 674 aa  97.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  29.44 
 
 		 463 aa  96.3  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.02 
 
 		 407 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  27.97 
 
 		 429 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5769  beta-lactamase  25.24 
 
 		 670 aa  96.3  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.84 
 
 		 385 aa  95.5  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.61 
 
 		 385 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  25.52 
 
 		 483 aa  95.1  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  28.93 
 
 		 2457 aa  95.1  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  26.01 
 
 		 533 aa  95.1  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  29.67 
 
 		 383 aa  94.7  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  29.24 
 
 		 411 aa  94.7  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  34.16 
 
 		 480 aa  94.7  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.05 
 
 		 487 aa  94.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  35.27 
 
 		 356 aa  94.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.33 
 
 		 385 aa  94.4  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  25.06 
 
 		 580 aa  94.4  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  22.91 
 
 		 681 aa  94  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  30.38 
 
 		 411 aa  94  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  28.45 
 
 		 389 aa  93.6  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  25.22 
 
 		 391 aa  93.6  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  28.22 
 
 		 456 aa  93.2  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  25.23 
 
 		 720 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  26.59 
 
 		 431 aa  92.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  26.84 
 
 		 385 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  23.66 
 
 		 380 aa  92.8  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>