More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2529 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  42.09 
 
 		 1102 aa  763    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.8 
 
 		 1091 aa  757    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  41.91 
 
 		 1085 aa  763    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  41.58 
 
 		 1087 aa  770    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  41.78 
 
 		 1085 aa  761    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2529  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1213 aa  2369    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.55 
 
 		 1122 aa  755    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  41.74 
 
 		 1086 aa  763    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  40.97 
 
 		 1082 aa  769    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  41.86 
 
 		 1085 aa  763    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  41.55 
 
 		 1095 aa  775    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  42.42 
 
 		 1083 aa  757    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  43.14 
 
 		 1087 aa  760    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  42.8 
 
 		 1087 aa  758    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  41.85 
 
 		 1083 aa  768    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  38.66 
 
 		 1173 aa  710    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  43.14 
 
 		 1087 aa  761    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.04 
 
 		 1081 aa  764    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  41.99 
 
 		 1085 aa  761    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00323  RND superfamily protein  36.67 
 
 		 1166 aa  602  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 		 1044 aa  496  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2230  acriflavin resistance protein  38.73 
 
 		 1156 aa  452  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  28.85 
 
 		 1071 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  29.46 
 
 		 1044 aa  441  9.999999999999999e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 		 1032 aa  435  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  27.1 
 
 		 1038 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  28.81 
 
 		 1058 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  29.24 
 
 		 1041 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  27.91 
 
 		 1070 aa  373  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1048 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 		 1074 aa  363  8e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  31.31 
 
 		 1043 aa  353  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  27.02 
 
 		 1059 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  26.93 
 
 		 1064 aa  343  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 		 1027 aa  339  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1498  acriflavin resistance protein  27.5 
 
 		 1110 aa  334  6e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.382997  hitchhiker  0.0048852 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  24.44 
 
 		 1026 aa  328  3e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  25.22 
 
 		 1013 aa  328  5e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  24.45 
 
 		 1030 aa  327  7e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  26.38 
 
 		 1044 aa  326  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  36.42 
 
 		 1011 aa  315  3.9999999999999997e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  26.46 
 
 		 1029 aa  313  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  23.32 
 
 		 1134 aa  308  6e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  31.37 
 
 		 1040 aa  306  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  34.97 
 
 		 1046 aa  305  3.0000000000000004e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  28.86 
 
 		 1063 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  30.94 
 
 		 1496 aa  297  8e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0771  heavy metal efflux pump, CzcA family  24 
 
 		 1020 aa  295  3e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.166724  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  29.7 
 
 		 1053 aa  293  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  24.45 
 
 		 1032 aa  290  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1143 aa  288  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  35.62 
 
 		 1043 aa  281  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  27.37 
 
 		 1034 aa  281  6e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3430  acriflavin resistance protein  24.38 
 
 		 1037 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.2 
 
 		 1049 aa  275  3e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  34.23 
 
 		 1034 aa  274  9e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  26.64 
 
 		 1049 aa  271  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  27.04 
 
 		 1049 aa  270  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  34.09 
 
 		 1044 aa  270  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  36.45 
 
 		 1050 aa  269  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  35.38 
 
 		 1017 aa  267  8.999999999999999e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  31.34 
 
 		 1023 aa  267  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  25.21 
 
 		 1041 aa  265  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  35.93 
 
 		 1027 aa  265  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  27.52 
 
 		 1066 aa  263  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  30.06 
 
 		 1039 aa  263  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2592  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 		 1108 aa  260  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.616304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 		 1051 aa  260  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1034 aa  258  5e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  27.04 
 
 		 1073 aa  254  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  24.42 
 
 		 1146 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1058 aa  253  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1041 aa  253  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  35.93 
 
 		 1177 aa  252  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2310  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  24.13 
 
 		 1062 aa  251  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2381  acriflavin resistance protein D  31.93 
 
 		 1092 aa  249  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.422424  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  34.98 
 
 		 1171 aa  248  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  34.87 
 
 		 1028 aa  248  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  26.8 
 
 		 1071 aa  246  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  35.12 
 
 		 1028 aa  245  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  26.72 
 
 		 1049 aa  245  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1191 aa  244  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3856  acriflavin resistance protein  25.32 
 
 		 1076 aa  244  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.112482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4165  acriflavin resistance protein  25.32 
 
 		 1076 aa  243  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.352988 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.35 
 
 		 1052 aa  243  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0917  acriflavin resistance protein  32.53 
 
 		 1054 aa  243  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  26.68 
 
 		 1049 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1068  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  23.31 
 
 		 1059 aa  242  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.186507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  31.91 
 
 		 1055 aa  241  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2270  acriflavin resistance protein  24.14 
 
 		 1049 aa  241  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446759  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  27.88 
 
 		 1058 aa  240  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4538  acriflavin resistance protein  24.98 
 
 		 1090 aa  239  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.22 
 
 		 1024 aa  238  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  26.78 
 
 		 1049 aa  238  6e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 		 1058 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  24.72 
 
 		 1048 aa  235  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  25.26 
 
 		 1165 aa  234  6e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  31.91 
 
 		 1006 aa  233  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 		 1029 aa  233  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  29.93 
 
 		 1053 aa  233  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>