More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2831 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  53.4 
 
 		 1039 aa  1053    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  65.87 
 
 		 1037 aa  1246    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  42.94 
 
 		 1023 aa  756    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  43.39 
 
 		 1039 aa  783    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  69.47 
 
 		 1047 aa  1343    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  71.67 
 
 		 1049 aa  1375    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.69 
 
 		 1026 aa  684    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  69.89 
 
 		 1048 aa  1438    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  39.44 
 
 		 1066 aa  665    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  38.99 
 
 		 1071 aa  688    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  39.83 
 
 		 1066 aa  669    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  53.12 
 
 		 1039 aa  1049    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  52.5 
 
 		 1039 aa  1037    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  53.02 
 
 		 1039 aa  1053    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.92 
 
 		 1048 aa  995    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  39.5 
 
 		 1036 aa  641    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.71 
 
 		 1092 aa  844    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  59.18 
 
 		 1034 aa  1197    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.96 
 
 		 1034 aa  741    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  43.38 
 
 		 1041 aa  742    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  71.39 
 
 		 1049 aa  1370    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  53.02 
 
 		 1039 aa  1030    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  52.55 
 
 		 1039 aa  1037    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  71.04 
 
 		 1049 aa  1400    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  98.49 
 
 		 1066 aa  2022    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  71.29 
 
 		 1031 aa  1418    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  65.1 
 
 		 1037 aa  1237    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  43.97 
 
 		 1045 aa  769    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  57.06 
 
 		 1043 aa  1090    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  70.5 
 
 		 1043 aa  1404    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  52.55 
 
 		 1039 aa  1037    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  68.55 
 
 		 1043 aa  1345    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  93.86 
 
 		 1058 aa  1874    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  51.98 
 
 		 1039 aa  1036    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  66.67 
 
 		 1075 aa  1313    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.72 
 
 		 1061 aa  679    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  43.35 
 
 		 1040 aa  719    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  71.48 
 
 		 1049 aa  1435    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  58.3 
 
 		 1047 aa  1128    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1058 aa  2055    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.24 
 
 		 1053 aa  635  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.59 
 
 		 1054 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  44.08 
 
 		 1030 aa  626  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  38.93 
 
 		 1032 aa  605  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  35.36 
 
 		 1052 aa  600  1e-170  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  37.27 
 
 		 1052 aa  569  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  38.13 
 
 		 1039 aa  558  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  35.05 
 
 		 1054 aa  549  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.53 
 
 		 1052 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  35 
 
 		 1046 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.08 
 
 		 1028 aa  539  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  34.27 
 
 		 1043 aa  538  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  35.14 
 
 		 1082 aa  533  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  33.74 
 
 		 1051 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  35.42 
 
 		 1029 aa  531  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0556  CzcA family heavy metal efflux protein  35.12 
 
 		 1076 aa  533  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  34.75 
 
 		 1064 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  34.89 
 
 		 1070 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  33.15 
 
 		 1053 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  33.15 
 
 		 1053 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  35.42 
 
 		 1075 aa  526  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  33.15 
 
 		 1053 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  35.14 
 
 		 1070 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  37.75 
 
 		 1054 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  33.15 
 
 		 1053 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  35.14 
 
 		 1070 aa  528  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  33.59 
 
 		 1062 aa  529  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3555  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.55 
 
 		 1062 aa  525  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3341  CzcA family heavy metal efflux protein  34.56 
 
 		 1075 aa  525  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  34.48 
 
 		 1061 aa  525  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0541  CzcA family heavy metal efflux protein  34.82 
 
 		 1074 aa  523  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.865334  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  33.21 
 
 		 1065 aa  524  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  35.48 
 
 		 1076 aa  525  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  34.38 
 
 		 1069 aa  522  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3791  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.67 
 
 		 1068 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0478  CzcA family heavy metal efflux protein  34.32 
 
 		 1068 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3847  CzcA family heavy metal efflux protein  34.47 
 
 		 1068 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  33.08 
 
 		 1047 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  33.12 
 
 		 1050 aa  521  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3973  CzcA family heavy metal efflux protein  34.47 
 
 		 1068 aa  522  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  33.86 
 
 		 1070 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  34.51 
 
 		 1040 aa  520  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  32.66 
 
 		 1040 aa  521  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  34.14 
 
 		 1083 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  33.77 
 
 		 1070 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1079  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.38 
 
 		 1022 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0885781  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  33.77 
 
 		 1070 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  33.77 
 
 		 1075 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  33.73 
 
 		 1048 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  33.61 
 
 		 1070 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0576  heavy metal efflux pump CzcA  34.46 
 
 		 1077 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  33.27 
 
 		 1048 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  33.77 
 
 		 1070 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  33.43 
 
 		 1048 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  33.7 
 
 		 1046 aa  515  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  33.68 
 
 		 1062 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.27 
 
 		 1063 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  31.35 
 
 		 1049 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  33.77 
 
 		 1048 aa  512  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  32 
 
 		 1049 aa  512  1e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>