More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2021 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2021  type II secretion system protein  100 
 
 		 396 aa  734    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.159835  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  29.87 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  31.93 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  29.87 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  29.11 
 
 		 421 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 405 aa  186  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  31.14 
 
 		 409 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  29.57 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  30.25 
 
 		 403 aa  182  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  30.4 
 
 		 417 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  30.02 
 
 		 405 aa  180  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  28.43 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  27.66 
 
 		 407 aa  178  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  30.45 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  29.53 
 
 		 408 aa  176  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  29.75 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  28.18 
 
 		 408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  27.85 
 
 		 408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  30.08 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 424 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  27.18 
 
 		 407 aa  173  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  28.32 
 
 		 407 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  28.79 
 
 		 408 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.89 
 
 		 423 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  28.54 
 
 		 405 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  31.71 
 
 		 409 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  28.54 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  29.29 
 
 		 406 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  28.79 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  28.39 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.82 
 
 		 402 aa  170  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  29.15 
 
 		 402 aa  169  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0674  type II secretion system protein  33.92 
 
 		 402 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471277 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  28.17 
 
 		 422 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.57 
 
 		 405 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  27.57 
 
 		 405 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  26.93 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  27.53 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  28.46 
 
 		 405 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  30.39 
 
 		 404 aa  166  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  28.29 
 
 		 420 aa  166  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  27.66 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  26.12 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.01 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  28.03 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  28.03 
 
 		 406 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  27.68 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  27.14 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  27.05 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  26.25 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2185  Type II secretion system F domain protein  30.75 
 
 		 403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.170941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  25.86 
 
 		 405 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  25.06 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  28.92 
 
 		 419 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  26.04 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.64 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  28.96 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  29.93 
 
 		 403 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  25.74 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 422 aa  160  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  26.11 
 
 		 417 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  26.55 
 
 		 417 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3372  type IV pilin biogenesis protein  29.15 
 
 		 399 aa  159  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  24.63 
 
 		 401 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  33.25 
 
 		 409 aa  159  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4249  general secretion pathway protein F  29.06 
 
 		 403 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  28.07 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  25 
 
 		 401 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  31.74 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  29.14 
 
 		 423 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  27.09 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  29.78 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  31.76 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1043  type IV pilin biogenesis protein  28.89 
 
 		 399 aa  157  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0343376 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  26.78 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  28.5 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  29.53 
 
 		 406 aa  157  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  28.54 
 
 		 401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  27.92 
 
 		 423 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 422 aa  156  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  27.2 
 
 		 405 aa  156  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  28.5 
 
 		 407 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  28.5 
 
 		 407 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0633  type IV pili biogenesis protein PilC  33.17 
 
 		 402 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.360472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  28.5 
 
 		 407 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  28.5 
 
 		 407 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  27.14 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  28.29 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  25.44 
 
 		 419 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0063  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilC  27.14 
 
 		 407 aa  155  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000657868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4537  type II secretion system protein  33.83 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3500  type IV pilin biogenesis protein  30.29 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  28.78 
 
 		 421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  24.69 
 
 		 403 aa  154  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  28.29 
 
 		 406 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  27.25 
 
 		 413 aa  153  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  28.21 
 
 		 423 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0155  type IV pilin biogenesis protein  28.24 
 
 		 400 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000866014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0159  type IV pilin biogenesis protein  27.74 
 
 		 400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  26.26 
 
 		 421 aa  152  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>