102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0708 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  100 
 
 
256 aa  508  1e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  32.7 
 
 
251 aa  87  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  29.78 
 
 
317 aa  59.3  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  28.5 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  26.46 
 
 
324 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  36.9 
 
 
495 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  25.82 
 
 
242 aa  55.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  25.82 
 
 
242 aa  55.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  29.94 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  30.11 
 
 
296 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  29.12 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  25.22 
 
 
305 aa  52.4  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  32.29 
 
 
411 aa  52.4  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  41.54 
 
 
248 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  41.54 
 
 
248 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  28.57 
 
 
308 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  29.58 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1850  putative tonB protein  29.1 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.473086  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  28.8 
 
 
248 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  29.25 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  33.33 
 
 
273 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  26.09 
 
 
201 aa  50.4  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  40.62 
 
 
276 aa  49.7  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0725  TonB family protein  30.77 
 
 
282 aa  49.7  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398336  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2822  TonB-like  32.22 
 
 
114 aa  48.9  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.628558  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  37.97 
 
 
267 aa  48.9  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  37.97 
 
 
267 aa  48.9  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  37.97 
 
 
267 aa  48.9  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  32.91 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  40 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  35.05 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  30.77 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  39.06 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  34.62 
 
 
308 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  30.77 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  30.68 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  32.58 
 
 
292 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  29.81 
 
 
243 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  32.5 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  32.5 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  33.93 
 
 
280 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  33.7 
 
 
289 aa  46.2  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  28.32 
 
 
279 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  34.78 
 
 
269 aa  45.8  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  35.85 
 
 
212 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  29.73 
 
 
239 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  38.89 
 
 
243 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  31.46 
 
 
246 aa  45.8  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  31.94 
 
 
283 aa  45.8  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  34.72 
 
 
244 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  40 
 
 
274 aa  45.8  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  28.57 
 
 
268 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  43.4 
 
 
277 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  28.43 
 
 
248 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  33 
 
 
323 aa  45.8  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  33 
 
 
323 aa  45.4  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  27.97 
 
 
268 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  43.4 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  28.57 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  37.74 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  29.21 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  36.84 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  29.55 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  31.25 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  35.82 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  36.73 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  25.44 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  33.71 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  34.52 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  36.73 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  37.74 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  42.59 
 
 
219 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  42.59 
 
 
219 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  35.21 
 
 
263 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  29.23 
 
 
235 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  33.96 
 
 
212 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  25.23 
 
 
276 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  34.69 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  39.62 
 
 
270 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  34.69 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  39.62 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  37.74 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  39.62 
 
 
270 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  25.71 
 
 
212 aa  43.9  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  34.72 
 
 
274 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  36.07 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  25 
 
 
298 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  31.82 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  31.18 
 
 
295 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  34.69 
 
 
226 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  30.99 
 
 
291 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  32.65 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  33.33 
 
 
277 aa  42.7  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  28.41 
 
 
291 aa  42.7  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  23.33 
 
 
292 aa  42.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0507  TonB family protein  29.76 
 
 
272 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00076316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  35.71 
 
 
253 aa  42.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  37.74 
 
 
287 aa  42.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  30.77 
 
 
244 aa  42  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  32.39 
 
 
284 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>