More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3569 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 365 aa  741    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  28.93 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  30.6 
 
 		 354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  30.06 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  28.33 
 
 		 349 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  26.23 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  38.68 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 496 aa  107  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 		 380 aa  107  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.75 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 501 aa  104  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 422 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  23.46 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  28.46 
 
 		 480 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  31.91 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 358 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.09 
 
 		 378 aa  97.8  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  28.77 
 
 		 367 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  28.11 
 
 		 399 aa  97.4  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 317 aa  97.1  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 389 aa  97.1  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 		 361 aa  96.7  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 325 aa  96.3  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  29.1 
 
 		 348 aa  96.3  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 		 359 aa  95.9  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 474 aa  95.9  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  29.02 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  28.08 
 
 		 418 aa  94.7  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  32.98 
 
 		 428 aa  94.4  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 		 358 aa  93.6  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 		 389 aa  92.8  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  27.79 
 
 		 330 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.39 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  24 
 
 		 453 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.56 
 
 		 377 aa  90.9  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2543  radical SAM family protein  28.31 
 
 		 379 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 		 377 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 		 800 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  31.75 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  27.63 
 
 		 393 aa  89.7  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  27.96 
 
 		 491 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  27.76 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  27.42 
 
 		 350 aa  87  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 398 aa  87  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 		 346 aa  86.7  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 354 aa  86.7  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  24.05 
 
 		 561 aa  86.7  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  26.54 
 
 		 332 aa  86.3  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 333 aa  86.3  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 438 aa  85.9  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  28.08 
 
 		 355 aa  86.3  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  27.42 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  32.2 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0897  radical SAM family protein  34.46 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  21.61 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  26.58 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  26.04 
 
 		 769 aa  84.3  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  30.53 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 		 565 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  25.66 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  23.35 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  30.94 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  28.44 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1309  radical SAM family protein  25.56 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  31.9 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  32.97 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  31.09 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1844  Radical SAM domain protein  21.18 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  24.07 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  24.61 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  29.28 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  36.04 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  23.17 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  22.47 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.63 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2623  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24 
 
 		 385 aa  79.3  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  27.94 
 
 		 450 aa  79.3  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.84 
 
 		 342 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>