More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2937 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2937  UspA domain protein  100 
 
 		 212 aa  408  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635989  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4578  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.911716  decreased coverage  0.000114407 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  32.84 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  35.07 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  33.09 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  35.97 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  32.64 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  31.34 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  29.66 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.11 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.59 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1686  UspA domain protein  33.09 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00978672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 294 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.2 
 
 		 145 aa  54.3  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  31.29 
 
 		 154 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  32.89 
 
 		 298 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 298 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 298 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  33.09 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  32.84 
 
 		 152 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 		 145 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  33.58 
 
 		 150 aa  53.9  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  40.98 
 
 		 148 aa  53.9  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  35.14 
 
 		 294 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  43.1 
 
 		 145 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  37.21 
 
 		 150 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 294 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.09 
 
 		 153 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  32.41 
 
 		 160 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  53.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  29.08 
 
 		 151 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  29.08 
 
 		 151 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3093  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 150 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 153 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  26.7 
 
 		 297 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  26.95 
 
 		 151 aa  52  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  31.21 
 
 		 151 aa  52  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  30.15 
 
 		 142 aa  52  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.86 
 
 		 128 aa  52  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  37.23 
 
 		 277 aa  52  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  26.24 
 
 		 149 aa  51.6  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  31.02 
 
 		 280 aa  51.6  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22870  universal stress protein UspA-like protein  35.33 
 
 		 149 aa  51.6  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.354321 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  25.53 
 
 		 149 aa  51.6  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  33.81 
 
 		 138 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  31.2 
 
 		 145 aa  51.2  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  27.01 
 
 		 750 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  37.04 
 
 		 292 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  32.12 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.27 
 
 		 142 aa  51.2  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  31.2 
 
 		 145 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  28.99 
 
 		 341 aa  51.2  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  31.03 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  35.46 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  26.29 
 
 		 622 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  26.57 
 
 		 151 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  35.46 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  50.88 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  50 
 
 		 138 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  35.46 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  35.46 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  35.46 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  43.75 
 
 		 151 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  28.47 
 
 		 345 aa  49.7  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  34.53 
 
 		 154 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  27.67 
 
 		 301 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  30.71 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  34.21 
 
 		 294 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  34.29 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  36.3 
 
 		 292 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  35.07 
 
 		 151 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  23.36 
 
 		 141 aa  49.7  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 324 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  48.28 
 
 		 137 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  30.07 
 
 		 147 aa  49.7  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 292 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 		 295 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  36.22 
 
 		 275 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  35.85 
 
 		 290 aa  49.7  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  27.74 
 
 		 139 aa  49.7  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 165 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  36.3 
 
 		 307 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  27.54 
 
 		 156 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  35.46 
 
 		 163 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  31.72 
 
 		 314 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 275 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.71 
 
 		 153 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  35.46 
 
 		 163 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>