More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1233 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 370 aa  748    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  72.8 
 
 		 373 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  72.68 
 
 		 367 aa  557  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  73.57 
 
 		 368 aa  554  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  72.25 
 
 		 373 aa  553  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  72.16 
 
 		 369 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  73.63 
 
 		 368 aa  546  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  73.18 
 
 		 371 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  70.57 
 
 		 367 aa  538  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  73.18 
 
 		 371 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  72.91 
 
 		 371 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  72.39 
 
 		 368 aa  536  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  71.74 
 
 		 374 aa  533  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  73.11 
 
 		 372 aa  534  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  70.19 
 
 		 378 aa  521  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  69.21 
 
 		 369 aa  521  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  67.76 
 
 		 370 aa  520  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  68.8 
 
 		 372 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  71.51 
 
 		 369 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  69.97 
 
 		 371 aa  513  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  69.59 
 
 		 371 aa  511  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  68.39 
 
 		 371 aa  511  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  67.6 
 
 		 375 aa  508  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  68.8 
 
 		 378 aa  509  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25200  peptide chain release factor 2  67.67 
 
 		 372 aa  501  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0337024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  68.25 
 
 		 371 aa  503  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  68.42 
 
 		 370 aa  500  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1865  peptide chain release factor 2  70.65 
 
 		 376 aa  494  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00679931  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  66.85 
 
 		 371 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  66.02 
 
 		 373 aa  491  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  65.47 
 
 		 371 aa  493  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13122  peptide chain release factor 2  71.71 
 
 		 378 aa  490  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.44652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  64.25 
 
 		 372 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  62.71 
 
 		 378 aa  471  1e-132  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1264  peptide chain release factor 2  65.22 
 
 		 375 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  64.13 
 
 		 366 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  61.88 
 
 		 374 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  64.31 
 
 		 386 aa  425  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  47.09 
 
 		 372 aa  355  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  50.28 
 
 		 383 aa  352  8e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  52.34 
 
 		 366 aa  348  8e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  50.69 
 
 		 367 aa  345  8e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  48.75 
 
 		 368 aa  344  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  48.66 
 
 		 377 aa  343  4e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  49.41 
 
 		 356 aa  338  9e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  47.88 
 
 		 367 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  51.83 
 
 		 330 aa  338  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  47.43 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  46.28 
 
 		 366 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  48.34 
 
 		 369 aa  336  2.9999999999999997e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  47.14 
 
 		 364 aa  333  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  45.24 
 
 		 373 aa  332  5e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  52.31 
 
 		 369 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  46.67 
 
 		 376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  45.48 
 
 		 366 aa  327  3e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  44.79 
 
 		 380 aa  325  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  45.99 
 
 		 357 aa  324  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  48.53 
 
 		 356 aa  324  2e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  46.76 
 
 		 367 aa  322  4e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  44.51 
 
 		 380 aa  322  6e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  49.39 
 
 		 330 aa  322  8e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  44.79 
 
 		 380 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  47.04 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  46.65 
 
 		 369 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  46.18 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  47.49 
 
 		 362 aa  320  3e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  46.29 
 
 		 372 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  44.23 
 
 		 380 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  48.71 
 
 		 378 aa  319  3.9999999999999996e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  53.72 
 
 		 317 aa  318  7e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  46.99 
 
 		 371 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  48.92 
 
 		 341 aa  318  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  45.89 
 
 		 367 aa  317  1e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  52.8 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  47.66 
 
 		 372 aa  315  8e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  47.96 
 
 		 332 aa  315  8e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  47.19 
 
 		 326 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  45.32 
 
 		 334 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  49.09 
 
 		 375 aa  313  1.9999999999999998e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0182  peptide chain release factor 2  45.59 
 
 		 354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01981  peptide chain release factor 2  45.59 
 
 		 354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0513147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  47.19 
 
 		 326 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  43.65 
 
 		 367 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  45.29 
 
 		 356 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  47.19 
 
 		 326 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  47.19 
 
 		 326 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4162  peptide chain release factor 2  53.25 
 
 		 317 aa  311  9e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  45 
 
 		 376 aa  311  9e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  45.28 
 
 		 375 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  45.06 
 
 		 361 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  46.25 
 
 		 327 aa  310  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02001  peptide chain release factor 2  45.29 
 
 		 354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  45.71 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  47.06 
 
 		 365 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  47.06 
 
 		 375 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  44.44 
 
 		 376 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  47.35 
 
 		 356 aa  308  9e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  46.8 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  47.38 
 
 		 365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  42.94 
 
 		 369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>