More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0187 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  100 
 
 		 205 aa  408  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  42.79 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 221 aa  95.5  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 200 aa  87.8  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 218 aa  85.1  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  33.54 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  31.28 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  29.41 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  27 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  25.39 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 497 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 241 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 420 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>