More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1128 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  300  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  84.35 
 
 		 147 aa  261  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  69.39 
 
 		 147 aa  222  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  57.24 
 
 		 153 aa  184  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  56.46 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  62.79 
 
 		 146 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  63.08 
 
 		 154 aa  168  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  51.16 
 
 		 158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  48.06 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0328  thioesterase superfamily protein  45.77 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  29.08 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  29.1 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  30.17 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  33 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  38.61 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  27.83 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  30.58 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  32.77 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  29.63 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  29.63 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  31.19 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  35 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  31.68 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  28.93 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  32.28 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  29.2 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  35.9 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  35.9 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  35.9 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  35.9 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  35.9 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  35.9 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  35.79 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  35.9 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  35.9 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.2 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  28.33 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  31.91 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  32.81 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  32.81 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  37.35 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 213 aa  52  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  33.65 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  29.31 
 
 		 153 aa  52  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  31.91 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 140 aa  52  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  28.24 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  29.31 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  32.81 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 159 aa  52  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  29.31 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  32.47 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  36.9 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  29.36 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  32.94 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0657  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.73 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  33.78 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 179 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  28.18 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  25.78 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  29.6 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  28.45 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 139 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 233 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  30.21 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  34.07 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  37.89 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  26.89 
 
 		 209 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  26.89 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  24.39 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  32.32 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  31.25 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  29.81 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>