More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3386 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3386  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  441  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4199  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2452  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  21.71 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 302 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  21.71 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 192 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  22.37 
 
 		 192 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  28.8 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 189 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  21.11 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 184 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  21.71 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  21.71 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  23.7 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  38.33 
 
 		 216 aa  48.9  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 192 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 203 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 186 aa  48.1  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3856  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 770 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  37.8 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 388 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>