198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1564 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  85.17 
 
 
391 aa  718    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  100 
 
 
391 aa  818    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  57.66 
 
 
391 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  44.39 
 
 
397 aa  350  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  41.93 
 
 
395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  33.5 
 
 
393 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  31.82 
 
 
403 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  26.92 
 
 
388 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  27.25 
 
 
401 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  26.9 
 
 
378 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  28.75 
 
 
402 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  27.09 
 
 
444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  26.55 
 
 
437 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  24.42 
 
 
437 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  24.42 
 
 
437 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  24.3 
 
 
390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  27.27 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  27.62 
 
 
428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  26.63 
 
 
426 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  26.63 
 
 
426 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  26.49 
 
 
429 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  26.34 
 
 
368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  25.38 
 
 
429 aa  126  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  26.23 
 
 
367 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  27.99 
 
 
418 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  25.19 
 
 
421 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  27.09 
 
 
420 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  26.03 
 
 
433 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  26.92 
 
 
431 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  23.93 
 
 
421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  26.79 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  26.41 
 
 
447 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  25.7 
 
 
420 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  25.89 
 
 
420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  25.89 
 
 
420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  25.38 
 
 
421 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  25.89 
 
 
420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  26.27 
 
 
399 aa  116  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  26.65 
 
 
405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  25.83 
 
 
390 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  25.83 
 
 
390 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  25.83 
 
 
390 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  24.38 
 
 
387 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  23.84 
 
 
409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  25.5 
 
 
374 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  26.12 
 
 
396 aa  113  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  26.41 
 
 
435 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  23.9 
 
 
400 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  25.65 
 
 
395 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  25 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  24.33 
 
 
409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  23.38 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  24.81 
 
 
432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  24.81 
 
 
432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  24.81 
 
 
432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  25.32 
 
 
362 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  26.7 
 
 
396 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  26.7 
 
 
396 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  26.7 
 
 
396 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  26.34 
 
 
396 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  25 
 
 
399 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  22.87 
 
 
409 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  26.7 
 
 
396 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  27.25 
 
 
396 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  26.45 
 
 
396 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  22.87 
 
 
409 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  22.87 
 
 
409 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  25.5 
 
 
392 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  25.12 
 
 
392 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  24.35 
 
 
398 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  23.43 
 
 
398 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  27.47 
 
 
409 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  26.23 
 
 
394 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
392 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
414 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  25.14 
 
 
378 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  25.23 
 
 
441 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  25.06 
 
 
400 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  26.79 
 
 
378 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  26 
 
 
361 aa  86.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  24.62 
 
 
372 aa  86.3  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  24.21 
 
 
404 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  23.4 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  25.67 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  25.67 
 
 
413 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.3 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.23 
 
 
350 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  29.48 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  27.69 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  24.42 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.67 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  24.03 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.53 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  25.3 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  27.1 
 
 
338 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.91 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  27.47 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  24.19 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>