279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1411 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  297  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 174 aa  86.7  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 171 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 171 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 184 aa  80.1  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  39.37 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  35.11 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  38.6 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  25.93 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  38.4 
 
 		 166 aa  60.1  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  31.09 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  25.6 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  35 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  24.83 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  35.42 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2043  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 175 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.831784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1381  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4468  transcriptional regulator, TrmB  33.59 
 
 		 206 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160154  normal  0.0294539 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  30.91 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  30.65 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 193 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4426  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610198 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 173 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 219 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 213 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  29.63 
 
 		 172 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>