More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1275 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1275  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 482 aa  929    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189046  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3470  D-amino-acid dehydrogenase  68.56 
 
 		 458 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1818  D-amino-acid dehydrogenase  61.41 
 
 		 419 aa  478  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0955  D-amino-acid dehydrogenase  54.72 
 
 		 416 aa  405  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.249989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0647  D-amino-acid dehydrogenase  52.52 
 
 		 452 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685795  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  50 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  52.14 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1087  FAD dependent oxidoreductase  54.33 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3596  FAD dependent oxidoreductase  51.54 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307288  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  50.59 
 
 		 415 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2431  D-amino-acid dehydrogenase  50.24 
 
 		 416 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0827  D-amino-acid dehydrogenase  51.97 
 
 		 419 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.365024  normal  0.0750347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4780  D-amino-acid dehydrogenase  48.48 
 
 		 432 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5615  D-amino-acid dehydrogenase  48.1 
 
 		 417 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.925695 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5323  D-amino-acid dehydrogenase  48.1 
 
 		 417 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.161486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5235  D-amino-acid dehydrogenase  48.1 
 
 		 417 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288943  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0198  FAD dependent oxidoreductase  43.71 
 
 		 408 aa  289  1e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.777626  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.2 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  26.81 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.4 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  28.98 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 418 aa  143  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  28 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  33.95 
 
 		 420 aa  139  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 		 416 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 415 aa  136  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  31.34 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  30.07 
 
 		 421 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.1 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.36 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.48 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0866  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.1 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47980  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.12 
 
 		 432 aa  133  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  30.68 
 
 		 435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3113  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.23 
 
 		 436 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.16 
 
 		 432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.8 
 
 		 432 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  27.27 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.8 
 
 		 432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  27.43 
 
 		 434 aa  130  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  30.9 
 
 		 419 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.73 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.73 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.15 
 
 		 432 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.73 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.73 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.23 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3994  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.68 
 
 		 441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 411 aa  126  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 425 aa  126  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.08 
 
 		 416 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.47 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.15 
 
 		 434 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2547  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.24 
 
 		 434 aa  124  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 411 aa  123  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0558  D-amino-acid dehydrogenase small subunit  25.95 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0313  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.24 
 
 		 421 aa  120  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 423 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 409 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.75 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1655  D-amino-acid dehydrogenase  29.95 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0719166  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  29.98 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2864  D-amino-acid dehydrogenase  26.17 
 
 		 417 aa  117  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.30815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0069  D-amino-acid dehydrogenase  31.03 
 
 		 411 aa  117  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 414 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0791  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.7 
 
 		 417 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2074  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.67 
 
 		 422 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00739126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 410 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.78 
 
 		 416 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  31.57 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  24.65 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  24.45 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.49 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  30.34 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0673  D-amino-acid dehydrogenase  27.21 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180164  hitchhiker  0.00553067 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0369  D-amino-acid dehydrogenase  27.19 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  28.02 
 
 		 422 aa  114  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 434 aa  114  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 431 aa  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.93 
 
 		 418 aa  113  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 416 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 423 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 416 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 432 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  29.88 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  29.78 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  29.17 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2122  D-amino-acid dehydrogenase  28.44 
 
 		 421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17481  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1503  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.54 
 
 		 425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.839298  normal  0.265321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>