More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0318 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  100 
 
 		 514 aa  977    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  68.61 
 
 		 422 aa  372  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  60.69 
 
 		 387 aa  331  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  64.14 
 
 		 400 aa  301  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  54.03 
 
 		 389 aa  297  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  56.82 
 
 		 395 aa  294  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  54.47 
 
 		 388 aa  289  9e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  57.19 
 
 		 387 aa  289  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  59.54 
 
 		 437 aa  289  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  54.47 
 
 		 388 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  54.47 
 
 		 388 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  56.6 
 
 		 383 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  57.89 
 
 		 415 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  54.97 
 
 		 398 aa  282  9e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  49.49 
 
 		 444 aa  280  5e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  56.86 
 
 		 390 aa  280  6e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  48.54 
 
 		 389 aa  279  9e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  48.79 
 
 		 468 aa  278  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  56.58 
 
 		 398 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  54.17 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  56.97 
 
 		 379 aa  273  7e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  56.39 
 
 		 419 aa  271  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  47.1 
 
 		 472 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  44.86 
 
 		 463 aa  270  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  46.02 
 
 		 479 aa  269  7e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  48.1 
 
 		 455 aa  269  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  48.1 
 
 		 455 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  48.1 
 
 		 455 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  47.75 
 
 		 455 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  46.92 
 
 		 460 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  47.75 
 
 		 455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  56.23 
 
 		 352 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  47.06 
 
 		 441 aa  267  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  47.4 
 
 		 455 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  49.13 
 
 		 474 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  47.4 
 
 		 455 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  48.29 
 
 		 624 aa  266  7e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  47.4 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  56.11 
 
 		 492 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  48.44 
 
 		 515 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  47.4 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  47.4 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  46.88 
 
 		 453 aa  265  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  47.22 
 
 		 454 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  48.1 
 
 		 521 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  48.1 
 
 		 523 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  46.37 
 
 		 464 aa  264  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  48.44 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  48.1 
 
 		 523 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  48.1 
 
 		 520 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  48.1 
 
 		 520 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  48.1 
 
 		 520 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  47.4 
 
 		 462 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  46.37 
 
 		 472 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  48.44 
 
 		 472 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  48.44 
 
 		 472 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  51.37 
 
 		 468 aa  263  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  46.92 
 
 		 459 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  50 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  46.23 
 
 		 569 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  44.85 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  50.54 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  45.03 
 
 		 449 aa  261  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  47.93 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  45.7 
 
 		 469 aa  261  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  47.06 
 
 		 456 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  44.86 
 
 		 572 aa  260  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  46.58 
 
 		 458 aa  260  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  47.86 
 
 		 560 aa  259  9e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  39.71 
 
 		 485 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  44.87 
 
 		 491 aa  259  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  44.18 
 
 		 488 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  44.86 
 
 		 491 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  47.95 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  51.44 
 
 		 432 aa  258  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  46.92 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  49.66 
 
 		 450 aa  257  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  43.1 
 
 		 467 aa  257  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  44.64 
 
 		 473 aa  256  5e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  46.37 
 
 		 417 aa  257  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  44.98 
 
 		 442 aa  256  6e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  52.48 
 
 		 393 aa  256  8e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  47.14 
 
 		 608 aa  256  9e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  44.18 
 
 		 467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  44.18 
 
 		 490 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  46.43 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  44.18 
 
 		 500 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  44.86 
 
 		 463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  44.52 
 
 		 491 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  44.18 
 
 		 482 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  38.72 
 
 		 485 aa  254  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  49.32 
 
 		 491 aa  254  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  45.55 
 
 		 477 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  44.18 
 
 		 484 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  44.18 
 
 		 433 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  44.18 
 
 		 483 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  46.37 
 
 		 437 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  45 
 
 		 452 aa  253  6e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  47.6 
 
 		 449 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  44.52 
 
 		 482 aa  253  6e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>