More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3662 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  100 
 
 		 260 aa  532  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  85.38 
 
 		 263 aa  457  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  85.38 
 
 		 263 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  85.38 
 
 		 260 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  85.38 
 
 		 260 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  85.38 
 
 		 260 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0480  transcriptional regulator NanR  85.38 
 
 		 263 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.426599  normal  0.544762 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  85.38 
 
 		 263 aa  457  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3550  transcriptional regulator NanR  85.38 
 
 		 260 aa  458  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0970448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  85.38 
 
 		 260 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3603  transcriptional regulator NanR  84.23 
 
 		 260 aa  447  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.445383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  84.23 
 
 		 260 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  84.23 
 
 		 260 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3638  transcriptional regulator NanR  84.23 
 
 		 260 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3533  transcriptional regulator NanR  85.95 
 
 		 242 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.606366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1517  transcriptional regulator NanR  56.52 
 
 		 234 aa  271  9e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.822162  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3837  transcriptional regulator NanR  45.98 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  41.85 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  39.29 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  36.24 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  36.96 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  32.41 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  36.52 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1066  transcriptional regulator NanR  42.37 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624285  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  30.24 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3193  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  29.13 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  31.22 
 
 		 227 aa  92.4  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  31.49 
 
 		 252 aa  92.4  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  33.06 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2079  regulatory protein GntR HTH  27.91 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.744782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  31.51 
 
 		 236 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.28 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  28.63 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  31.6 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  31.6 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  32.66 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  31.6 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  33.62 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  31.25 
 
 		 237 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  31.06 
 
 		 226 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  28.44 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  31.33 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  32.2 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  29.33 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4787  GntR domain protein  28.39 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  28.25 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  29.82 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.67 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3603  GntR domain-containing protein  31.05 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550725  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  29.65 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  29.02 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2500  GntR domain protein  29.02 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  25.99 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  28.44 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  27.83 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1580  GntR domain protein  28.87 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  29.91 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  29.2 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  28.22 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  30.43 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  30.4 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  30.94 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  25.22 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  29.33 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0539  GntR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  28.26 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  28.51 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  26.34 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  30.09 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  29.65 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  26.67 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  29.83 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>