182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2576 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2576  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
614 aa  1260    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1342  5'-Nucleotidase domain protein  25.45 
 
 
618 aa  139  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.206839  normal  0.550173 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.22 
 
 
419 aa  107  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  32.93 
 
 
434 aa  70.1  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 
422 aa  69.7  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 
441 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  26.59 
 
 
461 aa  65.1  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 
435 aa  63.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  24.88 
 
 
447 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  23.24 
 
 
461 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  29.1 
 
 
495 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 
451 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 
451 aa  63.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 
432 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  36.89 
 
 
460 aa  62  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
462 aa  61.6  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 
434 aa  60.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.61 
 
 
408 aa  60.1  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7707  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.03 
 
 
485 aa  59.7  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1492  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.56 
 
 
441 aa  59.3  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 
461 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 
452 aa  58.9  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 
432 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.75 
 
 
451 aa  58.2  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 
424 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 
429 aa  57.8  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 
434 aa  57.4  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 
453 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 
422 aa  56.6  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  32.43 
 
 
493 aa  57  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 
419 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  41.82 
 
 
442 aa  56.2  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 
444 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  28.8 
 
 
419 aa  55.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 
416 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 
433 aa  55.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  20.9 
 
 
426 aa  54.7  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 
434 aa  54.3  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  22.56 
 
 
424 aa  54.3  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 
442 aa  54.3  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.95 
 
 
438 aa  54.3  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  43.64 
 
 
445 aa  53.9  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 
418 aa  53.9  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 
431 aa  53.9  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.71 
 
 
421 aa  53.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.28 
 
 
416 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0061  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 
462 aa  53.5  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 
427 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
419 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.85 
 
 
428 aa  53.5  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 
426 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 
422 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 
436 aa  53.5  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  26.38 
 
 
410 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  24.28 
 
 
416 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.32 
 
 
412 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  21.18 
 
 
421 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0494  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
465 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  21.8 
 
 
439 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 
422 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 
427 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 
470 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 
423 aa  52  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  20.62 
 
 
435 aa  52.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 
435 aa  51.6  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  37.14 
 
 
427 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  20.59 
 
 
441 aa  51.6  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 
410 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.24 
 
 
484 aa  51.2  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  29.01 
 
 
420 aa  50.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 
434 aa  50.8  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
429 aa  50.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 
424 aa  50.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
448 aa  50.4  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 
441 aa  50.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 
460 aa  50.4  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.95 
 
 
431 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 
420 aa  50.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 
441 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  44.64 
 
 
424 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.32 
 
 
406 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 
467 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  44.64 
 
 
424 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2170  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 
428 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4984  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 
432 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000108283  decreased coverage  0.000897425 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.09 
 
 
426 aa  50.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.04 
 
 
422 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 
410 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 
432 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  23.34 
 
 
425 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 
412 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 
443 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  38.18 
 
 
445 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.39 
 
 
435 aa  49.7  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.52 
 
 
438 aa  49.3  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 
430 aa  49.7  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 
421 aa  48.9  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.12 
 
 
426 aa  48.5  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 
420 aa  48.5  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  39.29 
 
 
445 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>