More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_1051 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  100 
 
 
289 aa  577  1e-164  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  91.29 
 
 
290 aa  533  1e-150  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  58.89 
 
 
290 aa  338  4e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  48.4 
 
 
286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  43.94 
 
 
290 aa  269  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  42.75 
 
 
300 aa  262  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  40.29 
 
 
308 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  39.49 
 
 
318 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  39.93 
 
 
311 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  43.21 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  39.56 
 
 
299 aa  242  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  38.41 
 
 
300 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  40.67 
 
 
298 aa  240  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  39.02 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  39.48 
 
 
311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  41.87 
 
 
320 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  37.76 
 
 
328 aa  228  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  40.28 
 
 
316 aa  228  8e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  40.64 
 
 
294 aa  227  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  39.3 
 
 
292 aa  227  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  39.93 
 
 
313 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  38.52 
 
 
284 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  38.69 
 
 
295 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  37.89 
 
 
282 aa  222  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  38.85 
 
 
300 aa  223  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  37.37 
 
 
292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  38.85 
 
 
282 aa  221  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  38.38 
 
 
312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  40 
 
 
310 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  39.53 
 
 
283 aa  217  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  36.69 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  37.93 
 
 
293 aa  214  9e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  37.04 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  37.89 
 
 
297 aa  209  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  35.34 
 
 
284 aa  209  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  36.4 
 
 
306 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  36.99 
 
 
340 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  36.99 
 
 
340 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  35.97 
 
 
302 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  34.93 
 
 
300 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  36.79 
 
 
281 aa  205  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  37.24 
 
 
340 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  37.59 
 
 
293 aa  205  9e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  36.08 
 
 
294 aa  202  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  37.02 
 
 
304 aa  202  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  36.04 
 
 
303 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  41.76 
 
 
283 aa  196  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2248  band 7 protein  36.52 
 
 
283 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  35.92 
 
 
293 aa  195  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  36.3 
 
 
287 aa  195  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  36.33 
 
 
289 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  34.84 
 
 
300 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  37.84 
 
 
281 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  34.95 
 
 
295 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  34.62 
 
 
298 aa  193  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  36.18 
 
 
294 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  37.77 
 
 
282 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  33.22 
 
 
297 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  37.13 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  36.59 
 
 
300 aa  189  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  36.59 
 
 
300 aa  189  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  35.47 
 
 
369 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  34.88 
 
 
289 aa  189  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  36.1 
 
 
289 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  37.13 
 
 
289 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  36.59 
 
 
286 aa  186  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  33.58 
 
 
291 aa  186  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  35.74 
 
 
289 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  33.81 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  33.92 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  33.45 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  31.56 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1795  HflC protein  37 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  34.95 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  37.55 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3332  band 7 protein  36.24 
 
 
283 aa  183  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453043  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  34.36 
 
 
295 aa  183  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  37.18 
 
 
289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  34.36 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  34.36 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  35.79 
 
 
288 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  34.72 
 
 
304 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  33.33 
 
 
282 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  34.64 
 
 
292 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  36.4 
 
 
281 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  33.67 
 
 
292 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  34.72 
 
 
304 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  36.88 
 
 
291 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  35.86 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  33.79 
 
 
301 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  34.39 
 
 
297 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  34.39 
 
 
297 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  34.14 
 
 
301 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  33.33 
 
 
298 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  32.46 
 
 
294 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  35.71 
 
 
289 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  35.71 
 
 
289 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  34.91 
 
 
292 aa  176  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  33.68 
 
 
297 aa  175  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  34.87 
 
 
301 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>