More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0782 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  57.14 
 
 		 569 aa  635    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182056  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  87.72 
 
 		 579 aa  1055    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 		 579 aa  1175    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.35 
 
 		 595 aa  464  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  40.28 
 
 		 566 aa  442  1e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  39.16 
 
 		 609 aa  435  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  36.63 
 
 		 616 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  37.59 
 
 		 617 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  36.24 
 
 		 614 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  37.54 
 
 		 605 aa  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.05 
 
 		 614 aa  422  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  36.49 
 
 		 616 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  37.16 
 
 		 600 aa  421  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.99 
 
 		 609 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  40.2 
 
 		 624 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  36.7 
 
 		 604 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.42 
 
 		 616 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.61 
 
 		 597 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.25 
 
 		 632 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  33.45 
 
 		 589 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.93 
 
 		 577 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.42 
 
 		 620 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2141  60 kDa inner membrane insertion protein  39.76 
 
 		 601 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.63 
 
 		 629 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.33 
 
 		 597 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.59 
 
 		 621 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7326  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.42 
 
 		 621 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.17 
 
 		 597 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.92 
 
 		 628 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.44 
 
 		 607 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.18 
 
 		 622 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.44 
 
 		 609 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.92 
 
 		 623 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.75 
 
 		 623 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.38 
 
 		 600 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.5 
 
 		 584 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.85 
 
 		 610 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1048  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.12 
 
 		 612 aa  379  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0029293  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.85 
 
 		 610 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.64 
 
 		 608 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.49 
 
 		 635 aa  375  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.83 
 
 		 630 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.45 
 
 		 626 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.12 
 
 		 606 aa  355  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  32.24 
 
 		 592 aa  349  6e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  29.34 
 
 		 556 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.54 
 
 		 575 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  30.97 
 
 		 542 aa  233  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  30.74 
 
 		 528 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  30.55 
 
 		 542 aa  231  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.74 
 
 		 567 aa  226  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  28.23 
 
 		 562 aa  226  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  32.39 
 
 		 557 aa  224  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  29.68 
 
 		 545 aa  223  7e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.49 
 
 		 560 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  29.1 
 
 		 536 aa  220  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  29.73 
 
 		 559 aa  219  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  35.65 
 
 		 562 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  26.68 
 
 		 545 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  29.57 
 
 		 552 aa  217  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  26.81 
 
 		 545 aa  216  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  27.76 
 
 		 534 aa  216  7e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  30.95 
 
 		 544 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.31 
 
 		 563 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  29.26 
 
 		 530 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  30.1 
 
 		 557 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.56 
 
 		 554 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  30.73 
 
 		 566 aa  214  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  30.72 
 
 		 537 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.16 
 
 		 553 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  27.81 
 
 		 570 aa  213  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.75 
 
 		 565 aa  213  7.999999999999999e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.88 
 
 		 578 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.41 
 
 		 560 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  36.1 
 
 		 551 aa  213  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.71 
 
 		 557 aa  213  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.57 
 
 		 560 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.13 
 
 		 578 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.56 
 
 		 554 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  26.93 
 
 		 542 aa  212  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.04 
 
 		 555 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.11 
 
 		 546 aa  211  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.28 
 
 		 560 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.11 
 
 		 546 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.99 
 
 		 560 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.11 
 
 		 546 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  30 
 
 		 541 aa  211  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  29.93 
 
 		 552 aa  210  5e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.28 
 
 		 581 aa  210  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.79 
 
 		 545 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.92 
 
 		 555 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.63 
 
 		 564 aa  207  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  33.14 
 
 		 539 aa  206  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  26.58 
 
 		 541 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.75 
 
 		 541 aa  206  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  29.85 
 
 		 544 aa  206  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  30.38 
 
 		 541 aa  205  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.98 
 
 		 566 aa  205  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  30.71 
 
 		 541 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  26.92 
 
 		 541 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>