More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0921 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 226 aa  461  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  63.68 
 
 		 223 aa  288  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  59.36 
 
 		 232 aa  260  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  58.45 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  49.77 
 
 		 218 aa  222  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  52.66 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  47.56 
 
 		 222 aa  204  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  51.17 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  48.8 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  49.55 
 
 		 228 aa  191  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  49.28 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  50 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  49.28 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  49.28 
 
 		 220 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  49.29 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  41.94 
 
 		 225 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  46.19 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  43.52 
 
 		 222 aa  181  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  46.89 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  44.5 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  45.83 
 
 		 250 aa  178  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  48.04 
 
 		 234 aa  178  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  44.98 
 
 		 226 aa  176  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  50.25 
 
 		 216 aa  175  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  48.54 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  42.38 
 
 		 224 aa  171  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  42.58 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  48.56 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  48.56 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  41.46 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  45.5 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  44.55 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  42.18 
 
 		 216 aa  161  9e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  38.86 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  42.4 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  43.81 
 
 		 225 aa  157  9e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  43.96 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  40 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  34.71 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  46.26 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  34.71 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  33.33 
 
 		 232 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  32.64 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  35.86 
 
 		 254 aa  138  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.79 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  34.66 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  37.56 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  30.96 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  36.15 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  38.3 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  35.81 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.61 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  42.94 
 
 		 297 aa  108  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  36.54 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  36.65 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  31.05 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  37.96 
 
 		 268 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  31.05 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  37.62 
 
 		 216 aa  105  7e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  33.47 
 
 		 296 aa  99  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  31.84 
 
 		 233 aa  98.2  9e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  34.39 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  31.28 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  34.21 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  34.54 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  41.4 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0797  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.99 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  32.63 
 
 		 228 aa  89  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.72 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  29.15 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  31.58 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  31.38 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.14 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  30.35 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  31.86 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.64 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.57 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  30.2 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  29.76 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  27.13 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  27.7 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0980  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.44 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000905623  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  24.75 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  25.62 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.87 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.63 
 
 		 270 aa  71.6  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.06 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  27.05 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2290  HhH-GPD  29.3 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.63 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  31.05 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  26.74 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2806  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.4 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.53 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  30.1 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  27.27 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  24.66 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  24.66 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  24.66 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  24.66 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>