More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1940 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1940  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 581 aa  1161    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0182  lytic transglycosylase, catalytic  51.87 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0175  transglycosylase SLT domain-containing protein  55.12 
 
 		 553 aa  347  4e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  38.48 
 
 		 482 aa  253  7e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  40.93 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  37.55 
 
 		 498 aa  146  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  37.13 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  37.55 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  40.08 
 
 		 488 aa  144  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  38.4 
 
 		 490 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  40.79 
 
 		 523 aa  143  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  36.21 
 
 		 462 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  37.55 
 
 		 485 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  37.13 
 
 		 485 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  37.13 
 
 		 449 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  36.93 
 
 		 451 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  36.28 
 
 		 508 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  32.85 
 
 		 501 aa  138  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  36.71 
 
 		 485 aa  138  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  36.29 
 
 		 525 aa  137  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1046  lytic transglycosylase, catalytic  42 
 
 		 450 aa  136  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.872  normal  0.0396105 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  36.19 
 
 		 502 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  33.68 
 
 		 502 aa  136  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  42.72 
 
 		 457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1222  putative transglycosylase  34.15 
 
 		 508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  34.83 
 
 		 476 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  38.56 
 
 		 511 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  36.26 
 
 		 472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  42.22 
 
 		 480 aa  133  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1230  extracellular solute-binding protein  39.27 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  39.69 
 
 		 494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  36.21 
 
 		 494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  37.8 
 
 		 456 aa  131  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  34.01 
 
 		 484 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  35.5 
 
 		 485 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  36.12 
 
 		 530 aa  130  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  35.02 
 
 		 479 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  35.96 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  34.01 
 
 		 534 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  34.88 
 
 		 486 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  34.88 
 
 		 486 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  34.88 
 
 		 513 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  34.78 
 
 		 480 aa  128  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  37.96 
 
 		 528 aa  126  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  38.64 
 
 		 467 aa  127  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0288  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.39 
 
 		 410 aa  126  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  33.08 
 
 		 494 aa  126  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  31.12 
 
 		 476 aa  126  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3794  putative transglycosylase  34.78 
 
 		 518 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1757  lytic transglycosylase, catalytic  38.59 
 
 		 471 aa  124  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  34.78 
 
 		 478 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  34.93 
 
 		 478 aa  124  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  34.93 
 
 		 478 aa  124  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0695  Lytic transglycosylase catalytic  40.2 
 
 		 523 aa  124  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.114922 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1110  Lytic transglycosylase catalytic  34.78 
 
 		 518 aa  123  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  33.73 
 
 		 457 aa  123  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02414  hypothetical protein  34.78 
 
 		 458 aa  123  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1119  putative transglycosylase  34.78 
 
 		 518 aa  123  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2711  putative transglycosylase  34.78 
 
 		 518 aa  123  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2844  putative transglycosylase  34.78 
 
 		 472 aa  123  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2712  putative transglycosylase  34.78 
 
 		 518 aa  123  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  34.89 
 
 		 476 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2924  putative transglycosylase  34.78 
 
 		 518 aa  123  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  34.89 
 
 		 476 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  34.89 
 
 		 476 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  34.89 
 
 		 476 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  34.5 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3043  putative transglycosylase  35.19 
 
 		 517 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.775137  normal  0.0587061 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3655  putative transglycosylase  34.96 
 
 		 493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  33.62 
 
 		 518 aa  121  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2311  putative transglycosylase  44.64 
 
 		 478 aa  120  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.736491  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2945  putative transglycosylase  36.05 
 
 		 514 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2833  putative transglycosylase  36.05 
 
 		 514 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.459911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2729  putative transglycosylase  36.05 
 
 		 514 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2770  putative transglycosylase  36.05 
 
 		 514 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2810  putative transglycosylase  36.05 
 
 		 514 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.28375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  32.7 
 
 		 718 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0975  lytic transglycosylase catalytic  40.53 
 
 		 482 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742746 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  28.85 
 
 		 511 aa  117  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  37.56 
 
 		 437 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  33.73 
 
 		 472 aa  110  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1113  lytic transglycosylase, catalytic  34.74 
 
 		 402 aa  95.1  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0126627  normal  0.0207439 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1272  soluble lytic transglycosylase  34.74 
 
 		 402 aa  94.7  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  38.04 
 
 		 714 aa  90.9  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  35.58 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1582  lytic transglycosylase, catalytic  30.86 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208694 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  44 
 
 		 196 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1506  Lytic transglycosylase catalytic  32.2 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0243609 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  42 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2792  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase-related protein  25.64 
 
 		 477 aa  72  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0399  Lytic transglycosylase catalytic  37.4 
 
 		 574 aa  70.5  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2552  transglycosylase SLT domain/extracellular solute-binding domain-containing protein  30.23 
 
 		 517 aa  70.5  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 261 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  43.3 
 
 		 191 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  39.58 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  42.06 
 
 		 241 aa  68.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  41.58 
 
 		 244 aa  68.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  39.42 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  40.52 
 
 		 204 aa  67  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  40.52 
 
 		 204 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>