More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2411 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  100 
 
 
146 aa  294  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  56.16 
 
 
147 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  37.06 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  32.65 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  32.65 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  33.1 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  33.79 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  31.97 
 
 
141 aa  67  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  27.59 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  29.53 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  30.63 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  34.25 
 
 
140 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
141 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
140 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  31.51 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  29.86 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  32.43 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  30.67 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  27.63 
 
 
160 aa  61.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  35.1 
 
 
140 aa  61.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  28.28 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
140 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
145 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  32.89 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1627  UspA domain-containing protein  39.77 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  31.29 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  30.34 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  28.38 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  29.05 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  31.29 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  28.38 
 
 
141 aa  57  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  31.47 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  30.61 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  27.27 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  30.32 
 
 
277 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  28.97 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  28.38 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  29.45 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  31.29 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  30.34 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  29.05 
 
 
187 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1529  hypothetical protein  31.72 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  29.17 
 
 
207 aa  55.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  34.62 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46410  universal stress protein family  32.67 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  32.89 
 
 
298 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  32.86 
 
 
281 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  26.32 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  27.4 
 
 
164 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 
153 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  30.87 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 
449 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1165  hypothetical protein  29.05 
 
 
146 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  31.91 
 
 
141 aa  53.9  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  25 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.87 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  29.8 
 
 
283 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  30.07 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  33.33 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  30.46 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2678  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 
318 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.159389 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  32.19 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 
325 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
317 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  28.3 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  28.3 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  28.3 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  28.3 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  28.3 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  30.97 
 
 
154 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  28.3 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 
140 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  28.38 
 
 
141 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  26.35 
 
 
297 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  29.37 
 
 
150 aa  51.2  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  28.57 
 
 
150 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  30 
 
 
159 aa  51.2  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  26.9 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  30.87 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  22.44 
 
 
168 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  31.54 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>