More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2021 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  37.31 
 
 		 1020 aa  692    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2021  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1038 aa  2096    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.343149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  29.3 
 
 		 1028 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  28.27 
 
 		 1014 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  29.48 
 
 		 1030 aa  409  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.57 
 
 		 1019 aa  406  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  28.07 
 
 		 1027 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1035 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1026 aa  388  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  29.16 
 
 		 1019 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1029 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  28.68 
 
 		 1039 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  28.23 
 
 		 1020 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04840  acriflavin resistance protein  27.74 
 
 		 1018 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1009 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6008  acriflavin resistance protein  29.35 
 
 		 1026 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  26.88 
 
 		 1092 aa  372  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 		 1043 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 		 1021 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 		 1021 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  27.87 
 
 		 1021 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.78 
 
 		 1044 aa  363  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  26.95 
 
 		 1043 aa  363  1e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  26.12 
 
 		 1025 aa  361  4e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  27.58 
 
 		 1021 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.17 
 
 		 1049 aa  355  2e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.55 
 
 		 1050 aa  353  7e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  27.35 
 
 		 1024 aa  353  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1046 aa  352  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  27.6 
 
 		 1022 aa  350  7e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2023  acriflavin resistance protein  26.85 
 
 		 1015 aa  350  9e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0990325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1047  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1021 aa  349  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0882711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  27.1 
 
 		 1025 aa  348  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  27.03 
 
 		 1025 aa  347  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  26.16 
 
 		 1008 aa  347  6e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1023 aa  347  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  26.94 
 
 		 1022 aa  345  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  27.26 
 
 		 1036 aa  345  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  26.33 
 
 		 1011 aa  344  5.999999999999999e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  26.45 
 
 		 1010 aa  343  7e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.08 
 
 		 1036 aa  343  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  25.97 
 
 		 1048 aa  343  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3935  acriflavin resistance protein  27.02 
 
 		 1077 aa  342  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 		 1018 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  26.66 
 
 		 1036 aa  342  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  25.91 
 
 		 1034 aa  342  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0394  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.99 
 
 		 1077 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  27.5 
 
 		 1044 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3127  acriflavin resistance protein  27.17 
 
 		 1071 aa  341  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0790763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  27.79 
 
 		 1043 aa  340  5.9999999999999996e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  25.86 
 
 		 1039 aa  340  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 		 1016 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  25.81 
 
 		 1039 aa  339  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  25.46 
 
 		 1018 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1036 aa  339  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1036 aa  338  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  27.19 
 
 		 1047 aa  338  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.27 
 
 		 1024 aa  338  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  25.93 
 
 		 1050 aa  338  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  26.79 
 
 		 1134 aa  338  3.9999999999999995e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  25.6 
 
 		 1023 aa  338  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  26.26 
 
 		 1046 aa  337  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.04 
 
 		 1027 aa  335  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  25.97 
 
 		 1025 aa  335  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  27.55 
 
 		 1063 aa  334  4e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0181  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1068 aa  334  4e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  25.53 
 
 		 1047 aa  335  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  26.21 
 
 		 1042 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  25.4 
 
 		 1039 aa  333  8e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  27.29 
 
 		 1074 aa  333  8e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  26.71 
 
 		 1032 aa  333  9e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  26.25 
 
 		 1021 aa  333  9e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0427  acriflavin resistance protein  25.84 
 
 		 1012 aa  333  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3851  acriflavin resistance protein  26.97 
 
 		 1077 aa  332  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.35925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1425  RND family mulitdrug efflux protein  26.38 
 
 		 1110 aa  332  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.400859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  25.92 
 
 		 1046 aa  332  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  25.79 
 
 		 1046 aa  331  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1058 aa  331  5.0000000000000004e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1388  acriflavin resistance protein  27.46 
 
 		 1078 aa  330  6e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00288524  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  26.72 
 
 		 1027 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4228  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1071 aa  330  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0330177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  27.51 
 
 		 1051 aa  329  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  26.18 
 
 		 1031 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2047  acriflavin resistance protein  26.99 
 
 		 1112 aa  329  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3538  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1057 aa  328  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.36 
 
 		 1033 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  25.46 
 
 		 1033 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  26.77 
 
 		 1046 aa  328  5e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  27.2 
 
 		 1040 aa  328  5e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  25.65 
 
 		 1017 aa  327  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 		 1017 aa  327  7e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0232  acriflavin resistance protein  26.58 
 
 		 1017 aa  327  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 		 1038 aa  326  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0590  acriflavin resistance protein  25.7 
 
 		 1011 aa  326  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  26.63 
 
 		 1025 aa  326  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  25.54 
 
 		 1014 aa  326  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 		 1034 aa  325  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  27.24 
 
 		 1067 aa  325  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  25.69 
 
 		 1045 aa  325  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2722  acriflavin resistance protein  26.74 
 
 		 1070 aa  325  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>