More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3911 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  100 
 
 		 485 aa  947    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  44.54 
 
 		 500 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  45.78 
 
 		 501 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  46.45 
 
 		 497 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  43.9 
 
 		 506 aa  338  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  45.79 
 
 		 501 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  42.32 
 
 		 496 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  42.39 
 
 		 508 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  45.45 
 
 		 497 aa  336  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  42.18 
 
 		 508 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  42.89 
 
 		 528 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  43.67 
 
 		 514 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  43.22 
 
 		 498 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  41.68 
 
 		 491 aa  328  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  39.47 
 
 		 524 aa  326  6e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  46.35 
 
 		 498 aa  325  8.000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  42.86 
 
 		 506 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  39.47 
 
 		 524 aa  324  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  43.35 
 
 		 500 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  39.51 
 
 		 520 aa  325  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  42.86 
 
 		 499 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  42.86 
 
 		 493 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  43.46 
 
 		 483 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  41.2 
 
 		 464 aa  323  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  43.46 
 
 		 483 aa  323  5e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  42.59 
 
 		 487 aa  322  8e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  42.3 
 
 		 503 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  46.31 
 
 		 524 aa  322  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  42.09 
 
 		 503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  42.31 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  41.92 
 
 		 502 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  42.59 
 
 		 496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  42.45 
 
 		 501 aa  319  7e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  42.89 
 
 		 501 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  42.01 
 
 		 504 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  42.95 
 
 		 501 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  41.51 
 
 		 473 aa  317  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  41.56 
 
 		 493 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  41.63 
 
 		 492 aa  316  5e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  40.69 
 
 		 498 aa  316  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  42.49 
 
 		 524 aa  316  6e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  43.88 
 
 		 526 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  42.7 
 
 		 473 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  41.34 
 
 		 516 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  41.54 
 
 		 496 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  44.81 
 
 		 537 aa  312  9e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  42.37 
 
 		 516 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  41.75 
 
 		 496 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  42.64 
 
 		 481 aa  311  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  44.69 
 
 		 511 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  38.9 
 
 		 479 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  39.15 
 
 		 482 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  40.45 
 
 		 528 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  37.68 
 
 		 475 aa  310  4e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  39.31 
 
 		 477 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  39.04 
 
 		 523 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  38.7 
 
 		 477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  38.26 
 
 		 523 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  40.66 
 
 		 474 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  40.65 
 
 		 508 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  39.96 
 
 		 578 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  38.73 
 
 		 492 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  40.82 
 
 		 528 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  40.74 
 
 		 520 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  43.17 
 
 		 588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  41.01 
 
 		 515 aa  304  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  42.73 
 
 		 509 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  40 
 
 		 520 aa  303  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  40.39 
 
 		 471 aa  302  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  41.32 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  38.73 
 
 		 522 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  37.88 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  37.68 
 
 		 474 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  41.81 
 
 		 517 aa  300  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  39.92 
 
 		 464 aa  300  6e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  41.65 
 
 		 511 aa  299  7e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  38.91 
 
 		 513 aa  299  8e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  38.91 
 
 		 513 aa  299  8e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  43.6 
 
 		 511 aa  299  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  39.43 
 
 		 466 aa  299  8e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  41.99 
 
 		 501 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  39.83 
 
 		 527 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  40.39 
 
 		 523 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  41.71 
 
 		 529 aa  298  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  40 
 
 		 473 aa  297  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  41.9 
 
 		 496 aa  296  5e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  40.22 
 
 		 479 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  38.91 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  41.48 
 
 		 499 aa  295  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  37.47 
 
 		 476 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  39.05 
 
 		 478 aa  293  6e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  40.8 
 
 		 491 aa  292  8e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  40.76 
 
 		 489 aa  291  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  41.52 
 
 		 489 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  37.53 
 
 		 527 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  40.83 
 
 		 527 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  40.08 
 
 		 476 aa  290  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  36.44 
 
 		 497 aa  290  5.0000000000000004e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  40.26 
 
 		 475 aa  289  8e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  39.41 
 
 		 485 aa  289  8e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>