255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2590 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  431  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  69.42 
 
 		 210 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  67.32 
 
 		 210 aa  298  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  62.62 
 
 		 210 aa  272  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  59.2 
 
 		 207 aa  257  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  56.92 
 
 		 208 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  56.16 
 
 		 207 aa  248  5e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  57.44 
 
 		 206 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  57.71 
 
 		 204 aa  246  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  55.78 
 
 		 208 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  55.05 
 
 		 208 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  57.58 
 
 		 209 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  55.71 
 
 		 209 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  56.19 
 
 		 209 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  55.71 
 
 		 209 aa  242  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  59.41 
 
 		 210 aa  241  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  54.76 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  55.61 
 
 		 208 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  59.31 
 
 		 210 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  57.44 
 
 		 210 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  58.42 
 
 		 210 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0658  phage integrase protein  56.06 
 
 		 210 aa  232  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  55.38 
 
 		 200 aa  228  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1287  integrase family protein  55.71 
 
 		 203 aa  222  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  51.3 
 
 		 198 aa  211  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  51.03 
 
 		 198 aa  208  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  53.71 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  51.3 
 
 		 198 aa  199  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  46.88 
 
 		 197 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0261  putative tyrosine recombinase XerD  56.21 
 
 		 175 aa  194  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  48.73 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  48.47 
 
 		 198 aa  191  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  48.47 
 
 		 198 aa  191  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  48.47 
 
 		 198 aa  191  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  48.45 
 
 		 197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  48.45 
 
 		 197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  47.42 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  49.49 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4334  phage integrase family protein  53.85 
 
 		 173 aa  168  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3446  phage integrase family protein  50.68 
 
 		 163 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.993422  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1167  hypothetical protein  78.21 
 
 		 78 aa  126  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1166  hypothetical protein  72.6 
 
 		 76 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0365  hypothetical protein  64.2 
 
 		 103 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0790  hypothetical protein  53.85 
 
 		 130 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.517667  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0280  phage integrase family site specific recombinase  66.15 
 
 		 66 aa  90.5  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0153  phage integrase family site specific recombinase  41.86 
 
 		 141 aa  88.6  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.246008  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2576  hypothetical protein  54.12 
 
 		 89 aa  88.6  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6970  hypothetical protein  54.41 
 
 		 88 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  28.26 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  26.88 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  28.86 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  26.47 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  26.2 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  29.67 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  27.62 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  30.05 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  27.67 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  27.67 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  27.95 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  27.98 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  28.22 
 
 		 301 aa  61.2  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  28.16 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  26.78 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  30.32 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  26.37 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  26.92 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  25.36 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  26.14 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.85 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  29.49 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  25.29 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  28.57 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  28.14 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  29.68 
 
 		 319 aa  54.7  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  27.54 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  26.99 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  27.08 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0393  tyrosine recombinase XerD  27.74 
 
 		 319 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543195  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1797  phage integrase  29.58 
 
 		 303 aa  53.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.742134 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 321 aa  53.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  27.72 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.75 
 
 		 330 aa  52.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  27.54 
 
 		 291 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  31.17 
 
 		 182 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  27.54 
 
 		 291 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0488  tyrosine recombinase XerD  29.49 
 
 		 319 aa  52  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3459  hypothetical protein  54.35 
 
 		 55 aa  51.6  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  27.44 
 
 		 302 aa  51.6  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  33.75 
 
 		 304 aa  50.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2709  integrase family protein  39.44 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000251547  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  25.53 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  26.22 
 
 		 317 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  26.88 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  24.39 
 
 		 308 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  25.53 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  26.88 
 
 		 291 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.83 
 
 		 308 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  27.38 
 
 		 299 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  26.09 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  25.16 
 
 		 304 aa  49.3  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>