279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0270 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
293 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  57.84 
 
 
296 aa  322  5e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  52.3 
 
 
291 aa  293  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.44 
 
 
301 aa  218  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  33.45 
 
 
287 aa  149  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.78 
 
 
312 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.14 
 
 
313 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  29.68 
 
 
311 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  28.88 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  28.52 
 
 
302 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  28.52 
 
 
302 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  28.16 
 
 
300 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  28.16 
 
 
302 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  28.47 
 
 
289 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  28.16 
 
 
300 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  27.9 
 
 
300 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 
329 aa  95.5  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  26.22 
 
 
292 aa  94  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  28.16 
 
 
281 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  28.57 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  26.49 
 
 
304 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  24.38 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  25.27 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  25.36 
 
 
293 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  24.72 
 
 
292 aa  86.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  26.71 
 
 
308 aa  86.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  26.07 
 
 
294 aa  86.3  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  25.71 
 
 
293 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 
282 aa  85.9  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  25.71 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  27.72 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  24.16 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  22.34 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  27.14 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  25.42 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  24.19 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  25.71 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  24.1 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  26.09 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  26.32 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  24.82 
 
 
300 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  24.76 
 
 
312 aa  79  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  24.82 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.51 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  27.24 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  23.08 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  27.27 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  26.98 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  24.82 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  25.7 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  28.63 
 
 
304 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  27.96 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  27.6 
 
 
512 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.48 
 
 
317 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  25.7 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  26.62 
 
 
343 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  25.31 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  28.17 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  26.72 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  27.87 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.45 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  30.57 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  24.91 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  26.87 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  26.52 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  25.36 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  25.36 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  30.29 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  23.02 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  25.58 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  26.95 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0435  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 
299 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  27.49 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  25 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.33 
 
 
306 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  25.7 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  24.83 
 
 
359 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  24.83 
 
 
359 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  25.09 
 
 
298 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 
298 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  27.43 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  23.7 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  26.72 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.71 
 
 
300 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  25.5 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.71 
 
 
313 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  24.8 
 
 
302 aa  62.4  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  25.08 
 
 
308 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  25.77 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  27.96 
 
 
298 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  21.74 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  26.38 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.32 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  24.41 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  24.5 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.53 
 
 
307 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  32.43 
 
 
324 aa  60.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>