More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1185 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 409 aa  801    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  31.85 
 
 		 425 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  33.77 
 
 		 392 aa  149  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1834  polysaccharide deacetylase  31.92 
 
 		 397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  34.98 
 
 		 251 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  35.32 
 
 		 204 aa  122  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 244 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 		 232 aa  120  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 		 247 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 1124 aa  117  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 		 256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  30.69 
 
 		 927 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  30.69 
 
 		 1115 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  30.69 
 
 		 1119 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.69 
 
 		 1115 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.02 
 
 		 1115 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  31.19 
 
 		 872 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.68 
 
 		 1115 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  37.44 
 
 		 220 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 		 241 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  32.85 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  30.2 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 		 213 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 		 213 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 		 213 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  37.44 
 
 		 241 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 		 213 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.94 
 
 		 241 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  33 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.42 
 
 		 241 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  37.23 
 
 		 242 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 240 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  37.37 
 
 		 317 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  35.9 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  39.23 
 
 		 284 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 		 221 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  36.92 
 
 		 217 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 		 217 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  40.85 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 		 241 aa  106  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 		 277 aa  106  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  30.27 
 
 		 212 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  30.43 
 
 		 479 aa  104  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 		 235 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 		 264 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  32.85 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  37.57 
 
 		 269 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 		 244 aa  103  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  33.33 
 
 		 417 aa  103  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  35.07 
 
 		 1101 aa  103  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  30.47 
 
 		 481 aa  102  9e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  27.9 
 
 		 263 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 232 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  29 
 
 		 238 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 479 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  36.95 
 
 		 212 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  33.03 
 
 		 272 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.8 
 
 		 251 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 430 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5514  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 		 252 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.77719  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  28.26 
 
 		 244 aa  99.8  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  23.56 
 
 		 258 aa  99.8  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 218 aa  99.8  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  33.51 
 
 		 373 aa  99.8  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 522 aa  99.4  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 302 aa  99.4  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 262 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 233 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 		 245 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 		 259 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 229 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  40.37 
 
 		 252 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 465 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  35.5 
 
 		 215 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0646  polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 		 275 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 		 258 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  38.67 
 
 		 227 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5477  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 206 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 		 294 aa  97.4  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 		 286 aa  97.4  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  37.7 
 
 		 267 aa  97.1  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 		 275 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  32.66 
 
 		 275 aa  97.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  32.66 
 
 		 275 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 		 275 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 		 204 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  28 
 
 		 238 aa  97.1  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  36.6 
 
 		 468 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 		 275 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  34.2 
 
 		 240 aa  97.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 		 275 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>