More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5477 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5477  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 206 aa  433  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2237  polysaccharide deacetylase  56.59 
 
 		 215 aa  252  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0661  polysaccharide deacetylase  54.11 
 
 		 205 aa  238  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  47.98 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  42.01 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  43.52 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2145  polysaccharide deacetylase  42.13 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0244  polysaccharide deacetylase  44.93 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 		 305 aa  118  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 264 aa  118  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  36.08 
 
 		 251 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 		 321 aa  115  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.71 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.2 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 302 aa  112  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 		 220 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  35.2 
 
 		 244 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 		 217 aa  111  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 		 241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 		 261 aa  108  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 		 276 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 		 275 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 		 275 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 		 275 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 		 275 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  35.87 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 372 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 		 275 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  34.62 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 522 aa  102  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 522 aa  101  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 275 aa  101  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  25.91 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 		 247 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  30.43 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  31 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  35.09 
 
 		 243 aa  99.4  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  31.44 
 
 		 244 aa  99  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 		 251 aa  99  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.02 
 
 		 417 aa  98.6  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  32.82 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 409 aa  97.8  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 		 234 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  30.32 
 
 		 468 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  27.46 
 
 		 258 aa  96.7  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 247 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 		 267 aa  95.9  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 		 233 aa  95.5  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 		 234 aa  95.5  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  32.49 
 
 		 234 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  31.89 
 
 		 405 aa  95.5  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 368 aa  94.7  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 425 aa  94.7  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  29.21 
 
 		 320 aa  94  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  32.8 
 
 		 488 aa  94  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  34.9 
 
 		 372 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  31.44 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  29.77 
 
 		 479 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  32.22 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 479 aa  92.8  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 		 465 aa  92.8  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  34.71 
 
 		 299 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  34.39 
 
 		 238 aa  92.4  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 234 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  29.21 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  34.03 
 
 		 238 aa  92  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 235 aa  91.3  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 		 222 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 		 317 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  31.49 
 
 		 373 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  30.96 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 		 246 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 324 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  27.94 
 
 		 242 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 283 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  27.72 
 
 		 503 aa  90.5  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  28.37 
 
 		 481 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 256 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  33.51 
 
 		 349 aa  90.1  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  30.46 
 
 		 234 aa  89.4  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  30.46 
 
 		 234 aa  89.4  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  30.46 
 
 		 234 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  33.72 
 
 		 301 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 345 aa  89  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  32.82 
 
 		 300 aa  89  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>