More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4274 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 418 aa  857    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  47.38 
 
 		 420 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  43.78 
 
 		 415 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  41.52 
 
 		 462 aa  351  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  41.26 
 
 		 441 aa  328  9e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  36.47 
 
 		 415 aa  266  7e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 		 440 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 		 437 aa  237  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.02 
 
 		 428 aa  209  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 415 aa  203  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  30.17 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  29.09 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2431  D-amino-acid dehydrogenase  29.65 
 
 		 416 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  28.09 
 
 		 415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.85 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1818  D-amino-acid dehydrogenase  29.11 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.1 
 
 		 434 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47980  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.71 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.71 
 
 		 416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.1 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.1 
 
 		 434 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.1 
 
 		 434 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.08 
 
 		 433 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3596  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307288  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4507  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.82 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.59 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.25 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.83 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0647  D-amino-acid dehydrogenase  28.36 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685795  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.4 
 
 		 418 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  27.62 
 
 		 433 aa  163  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 410 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.54 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1503  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.74 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.839298  normal  0.265321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  26.62 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0948  D-amino-acid dehydrogenase  26.64 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.59 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2253  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.72 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2864  D-amino-acid dehydrogenase  26.94 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.30815  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.33 
 
 		 416 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  29.19 
 
 		 419 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.32 
 
 		 419 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5009  D-amino-acid dehydrogenase  26.03 
 
 		 448 aa  160  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3659  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.52 
 
 		 418 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2082  D-amino-acid dehydrogenase  27.08 
 
 		 418 aa  159  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3520  D-amino-acid dehydrogenase  28.14 
 
 		 444 aa  159  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.553559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0827  D-amino-acid dehydrogenase  29.8 
 
 		 419 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.365024  normal  0.0750347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 423 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.59 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.59 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6079  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.72 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1957  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.72 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.36 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3470  D-amino-acid dehydrogenase  27.55 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0148  D-amino-acid dehydrogenase  26.45 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.739629  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5615  D-amino-acid dehydrogenase  27.25 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.925695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0751  D-amino-acid dehydrogenase  26.25 
 
 		 433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0131  D-amino-acid dehydrogenase  25.29 
 
 		 444 aa  156  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.814059  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.94 
 
 		 416 aa  156  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4229  D-amino-acid dehydrogenase  27.5 
 
 		 415 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.825619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5323  D-amino-acid dehydrogenase  27.25 
 
 		 417 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.161486 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  26.18 
 
 		 446 aa  155  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5235  D-amino-acid dehydrogenase  27.25 
 
 		 417 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288943  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0090  D-amino-acid dehydrogenase  24.65 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0071  D-amino-acid dehydrogenase  24.65 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 420 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3630  D-amino-acid dehydrogenase  26.38 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258766 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.47 
 
 		 436 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4780  D-amino-acid dehydrogenase  27.4 
 
 		 432 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.49 
 
 		 421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4473  D-amino-acid dehydrogenase  28.11 
 
 		 417 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 409 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0558  D-amino-acid dehydrogenase small subunit  25.59 
 
 		 419 aa  152  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2380  D-amino-acid dehydrogenase  25.65 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 416 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1408  D-amino-acid dehydrogenase  26.38 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0369  D-amino-acid dehydrogenase  26.7 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2746  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.29 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0984937  decreased coverage  0.0000603863 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  27.03 
 
 		 439 aa  151  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3159  D-amino-acid dehydrogenase  26.48 
 
 		 436 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  25.24 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3113  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.47 
 
 		 436 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2093  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.06 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59754  normal  0.0350619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.65 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  27.83 
 
 		 421 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 411 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3886  D-amino-acid dehydrogenase  26.24 
 
 		 436 aa  150  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.694538 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.34 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 431 aa  150  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.06 
 
 		 418 aa  149  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3589  D-amino-acid dehydrogenase  26.57 
 
 		 424 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0959455  hitchhiker  0.00000935542 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0740  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.94 
 
 		 434 aa  149  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.968608  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>