293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2093 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  57.49 
 
 		 283 aa  343  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  32.42 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  29.35 
 
 		 309 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  30 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  27.92 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  30.07 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  30.45 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  26.92 
 
 		 295 aa  108  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  30.43 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  25.09 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  24.13 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  28.15 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  28.15 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  28.28 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  25.6 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  26.69 
 
 		 291 aa  99  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  26.03 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  24.57 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  27.75 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  30.89 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  23.96 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  24.07 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  28.33 
 
 		 340 aa  89.7  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  24.33 
 
 		 309 aa  89  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  28.11 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  25.68 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25.08 
 
 		 291 aa  86.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  27.34 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  26.05 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  24.58 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  24.63 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  26.13 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  29.3 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  26.4 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  27.61 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.79 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  29.58 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  25.29 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  24.81 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  30.25 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  24.38 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  28.81 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  28.98 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  23.57 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  28.95 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  26.29 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0823  protein of unknown function DUF58  26.89 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  27.13 
 
 		 447 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  26.99 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  24.91 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  25.29 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  26.74 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  25.81 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  27.82 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  25.81 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  25.21 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  26.05 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  25.78 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.95 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  28.26 
 
 		 443 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  24.81 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  28.86 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  28.04 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  26.57 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  24.02 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  23.05 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  25.7 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  24.41 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  25.32 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  28.19 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  26.29 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  25.32 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  25.32 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  31.36 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  25.9 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  24.05 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  25.1 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  25.1 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  23.65 
 
 		 287 aa  67  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  25.1 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  24.57 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  26.09 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.2 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  24.36 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  27.96 
 
 		 444 aa  65.9  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  36.84 
 
 		 575 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  28.65 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  28.72 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  21.11 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  25.32 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  24.35 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  25.32 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  32.2 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  26.88 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  24.15 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  36.9 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  22.51 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  26.77 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  26.77 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>