112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1828 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1828  response regulator receiver protein  100 
 
 		 130 aa  267  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000105938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  27.42 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3744  response regulator receiver protein  28.32 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  hitchhiker  0.00363561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5055  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000148317  normal  0.0527856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1220  CheY-like response regulator  31.3 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0243191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  23.39 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1464  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000820366  normal  0.014977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1791  response regulator receiver protein  26.13 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  25.78 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 1193 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2346  histidine kinase  27.2 
 
 		 372 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  27.56 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  23.81 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  22.69 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  28 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2234  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 		 935 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4196  response regulator receiver domain-containing protein  25.53 
 
 		 215 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  27.01 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  25.56 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  22.13 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.78 
 
 		 945 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  25.81 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3993  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0199898 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  23.62 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2074  response regulator receiver protein  26.77 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1372  response regulator receiver protein  27.34 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.786279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.76 
 
 		 935 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  22.48 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  29.41 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  27.82 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0372  response regulator receiver protein  25.2 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 		 1344 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  25.81 
 
 		 227 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.98 
 
 		 837 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  27.07 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5155  response regulator receiver protein  29.67 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.26 
 
 		 1178 aa  43.5  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  26.19 
 
 		 149 aa  43.5  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2083  hypothetical protein  27.62 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2073  hypothetical protein  27.62 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  30.48 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  26.32 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  22.4 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0734  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  24.19 
 
 		 477 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  30.1 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 		 410 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 		 758 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.6 
 
 		 576 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  26.8 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  23.2 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  27.17 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.89 
 
 		 796 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 871 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.9 
 
 		 747 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4888  response regulator receiver protein  24.24 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156233  normal  0.549385 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.2 
 
 		 759 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  22.14 
 
 		 144 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2095  response regulator receiver protein  23.08 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  22.66 
 
 		 132 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2912  response regulator receiver protein  23.77 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  22.5 
 
 		 149 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.4 
 
 		 714 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4314  response regulator receiver protein  24.79 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  31.94 
 
 		 242 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 1054 aa  41.2  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  25.95 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2379  two component transcriptional regulator  23.93 
 
 		 250 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.524484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0660  response regulator receiver protein  25 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0361  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.46 
 
 		 233 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324623  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 		 886 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1023 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 		 858 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  24.22 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1398  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7367  two component transcriptional regulator  28.46 
 
 		 233 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.02 
 
 		 1021 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2841  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  25.71 
 
 		 308 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0348  transcriptional regulatory protein  28.46 
 
 		 233 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.242627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0443  two component transcriptional regulator  28.46 
 
 		 233 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  26.06 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 823 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2147  two component transcriptional regulator  26.19 
 
 		 235 aa  40.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4528  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.78 
 
 		 229 aa  40.4  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5014  response regulator receiver protein  22.96 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0128  two-component response regulator  25.81 
 
 		 228 aa  40.8  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.4797  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.02 
 
 		 378 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 		 791 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>