More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2379 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2379  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  497  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.524484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5920  two component transcriptional regulator  63.09 
 
 		 247 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  60.89 
 
 		 234 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  60.89 
 
 		 234 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  60.89 
 
 		 234 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  60.89 
 
 		 232 aa  258  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  60.89 
 
 		 232 aa  258  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  60.89 
 
 		 234 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  60.89 
 
 		 234 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  60 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  58.41 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 232 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1244  DNA-binding transcriptional activator KdpE  56.64 
 
 		 229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00224308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2931  DNA-binding transcriptional activator KdpE  55.02 
 
 		 229 aa  251  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.56 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  55.26 
 
 		 226 aa  250  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  60.44 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 232 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  60.44 
 
 		 232 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.64 
 
 		 225 aa  249  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  56.64 
 
 		 225 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  56.64 
 
 		 225 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  56.64 
 
 		 225 aa  249  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1126  DNA-binding transcriptional activator KdpE  54.39 
 
 		 226 aa  248  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296902  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  56.19 
 
 		 225 aa  248  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  56.19 
 
 		 225 aa  248  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  56.19 
 
 		 225 aa  248  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  60.44 
 
 		 232 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  60.44 
 
 		 232 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  60.44 
 
 		 232 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  55.75 
 
 		 225 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0810  DNA-binding transcriptional activator KdpE  56.19 
 
 		 225 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  56.19 
 
 		 225 aa  247  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  57.08 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0824  DNA-binding transcriptional activator KdpE  56.19 
 
 		 225 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0770111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0860  DNA-binding transcriptional activator KdpE  56.19 
 
 		 225 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0750  DNA-binding transcriptional activator KdpE  56.19 
 
 		 225 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.358042  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  59.56 
 
 		 232 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  57.33 
 
 		 231 aa  244  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0763  DNA-binding transcriptional activator KdpE  55.75 
 
 		 225 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1206  two component transcriptional regulator  55.36 
 
 		 225 aa  242  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3504  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.59 
 
 		 248 aa  241  7e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  56.95 
 
 		 234 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  55.75 
 
 		 236 aa  241  9e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.25 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.25 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.05 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  55.56 
 
 		 231 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1155  DNA-binding transcriptional activator KdpE  54.5 
 
 		 209 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3578  DNA-binding transcriptional activator KdpE  54.5 
 
 		 209 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.693422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1102  DNA-binding transcriptional activator KdpE  54.5 
 
 		 209 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000603864  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2502  two-component response regulator of kdp operon  57.4 
 
 		 234 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10580  Response regulator  51.12 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  52.68 
 
 		 230 aa  225  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1666  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3557  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  53.78 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  51.12 
 
 		 230 aa  219  5e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 		 231 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 		 231 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  52.91 
 
 		 233 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.11 
 
 		 226 aa  205  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 228 aa  205  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  47.56 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.14 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  48.43 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  52.02 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  45.19 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 231 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6788  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.81 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.241896 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  47.37 
 
 		 230 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  47.37 
 
 		 230 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0450  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 232 aa  197  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  47.11 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0742  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 235 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 230 aa  192  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2842  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3763  two component transcriptional regulator  46.89 
 
 		 243 aa  190  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225565 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  45.06 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 		 231 aa  188  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  46.72 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  45.41 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.79 
 
 		 225 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>