More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1445 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1445  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 366 aa  749    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  45.48 
 
 		 399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5404  signal transduction histidine kinase, LytS  46.11 
 
 		 362 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0836  signal transduction histidine kinase, LytS  41.58 
 
 		 380 aa  276  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  44.33 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  42.86 
 
 		 445 aa  166  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  41.45 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6059  signal transduction histidine kinase, LytS  42.71 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  38.79 
 
 		 362 aa  156  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  40.8 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1474  signal transduction histidine kinase, LytS  44 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0623535 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  41.38 
 
 		 454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  42.45 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2790  histidine kinase internal region  39.07 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  40 
 
 		 359 aa  145  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  35.42 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  35.34 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7150  signal transduction histidine kinase, LytS  40.7 
 
 		 345 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0757  signal transduction histidine kinase, LytS  37.62 
 
 		 339 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  35.68 
 
 		 1021 aa  135  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  33.63 
 
 		 340 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2660  signal transduction histidine kinase, LytS  36.89 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3230  signal transduction histidine kinase, LytS  28.46 
 
 		 364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  40.31 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  36.87 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0805  signal transduction histidine kinase, LytS  43.02 
 
 		 365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  27.67 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0799  signal transduction histidine kinase, LytS  35.2 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2090  signal transduction histidine kinase, LytS  38.66 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0316441  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  36.63 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4669  signal transduction histidine kinase, LytS  33.77 
 
 		 523 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.959572  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1316  signal transduction histidine kinase, LytS  38.31 
 
 		 372 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0857  signal transduction histidine kinase, LytS  31.27 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  38.02 
 
 		 448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1793  signal transduction histidine kinase, LytS  34.75 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2254  signal transduction histidine kinase, LytS  30.54 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.694185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2255  signal transduction histidine kinase, LytS  30.29 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1210  histidine kinase internal region  32.98 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  31.05 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5336  signal transduction histidine kinase, LytS  29.65 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.339163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0602  signal transduction histidine kinase, LytS  32.68 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5825  signal transduction histidine kinase, LytS  32.64 
 
 		 341 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.466187  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1792  signal transduction histidine kinase, LytS  31.85 
 
 		 323 aa  89.4  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  33.5 
 
 		 381 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  25.75 
 
 		 370 aa  86.3  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  28.38 
 
 		 393 aa  86.3  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  31.58 
 
 		 413 aa  86.3  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  30.99 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  31.4 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  36.14 
 
 		 586 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  28.96 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  33.96 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  28.79 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  25.3 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  34.78 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  30.5 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  30.57 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.41 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  28.66 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  29.07 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0182  sensor histidine kinase, putative  29.35 
 
 		 581 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  28.41 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  32.61 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  32.8 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  30.59 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  23 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  27.96 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  31.54 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  37.6 
 
 		 552 aa  73.6  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  27.64 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1017  sensor histidine kinase, putative  24.79 
 
 		 579 aa  73.2  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  32.85 
 
 		 591 aa  72.8  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  30.46 
 
 		 418 aa  72.8  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  28.18 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  34.52 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  28.22 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  29.95 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  30.26 
 
 		 645 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  27.78 
 
 		 566 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  30.1 
 
 		 380 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 388 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  27.78 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  31.49 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  32.92 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  26.5 
 
 		 482 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3669  sensory transduction protein kinase AlgZ  27.69 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147493  normal  0.157843 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  38.39 
 
 		 578 aa  70.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  29.69 
 
 		 1016 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  28.57 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2405  sensor histidine kinase  29.93 
 
 		 512 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1966  sensor histidine kinase  30.41 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  27.42 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  29.08 
 
 		 576 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  32.81 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  30.77 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  27.96 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  27.27 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  28.57 
 
 		 432 aa  69.3  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  24.45 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>