84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3250 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3250  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 317 aa  663    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1847  polysaccharide deacetylase  40.73 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1500  polysaccharide deacetylase family protein  31.83 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.89834  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  28.8 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  27.74 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  25.9 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  26.07 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  24.48 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  25.17 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  22.92 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14351  hypothetical protein  25.08 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.188906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  23.41 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  23.76 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  24.12 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  24.64 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  22.36 
 
 		 386 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  31.97 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  22.51 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 		 352 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  30.68 
 
 		 590 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  24.39 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  23.47 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  23.76 
 
 		 352 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  24.32 
 
 		 398 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  24.05 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  24.68 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 		 255 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  23.85 
 
 		 672 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  21.6 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  29.55 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 350 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  22.37 
 
 		 352 aa  49.7  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  24.23 
 
 		 398 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 400 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  24.23 
 
 		 398 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  30.86 
 
 		 224 aa  48.9  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  21.96 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 		 234 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  24.02 
 
 		 353 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  22.22 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  24.28 
 
 		 408 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  24.09 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1287  polysaccharide deacetylase  24 
 
 		 366 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  normal  0.442268 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  21.54 
 
 		 339 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  22.14 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 		 322 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  37.7 
 
 		 239 aa  45.8  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  37.7 
 
 		 239 aa  45.8  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  23.89 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  27.37 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  21.14 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  31.17 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  35.53 
 
 		 898 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  29 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  30.23 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  28.85 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  32.89 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  36.49 
 
 		 900 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2617  polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 		 282 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  40.35 
 
 		 270 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  31.52 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  31.58 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  25.67 
 
 		 645 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  38.24 
 
 		 695 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  24.77 
 
 		 352 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  41.07 
 
 		 697 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  22.83 
 
 		 362 aa  43.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 598 aa  42.7  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  26.44 
 
 		 306 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  48.78 
 
 		 698 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  46.51 
 
 		 697 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  46.51 
 
 		 697 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 		 890 aa  42.7  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 		 276 aa  42.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  36.76 
 
 		 697 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>