74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3432 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3432  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  100 
 
 
1281 aa  2642    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1694  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.02 
 
 
1296 aa  550  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0847615  decreased coverage  0.00494316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2557  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  33.46 
 
 
1946 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2558  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  31.72 
 
 
1714 aa  342  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.13 
 
 
1288 aa  309  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2913  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.86 
 
 
1488 aa  193  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0246207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2038  hypothetical protein  29.57 
 
 
1895 aa  183  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.46 
 
 
1482 aa  183  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1017  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.01 
 
 
1270 aa  177  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000312457  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1370  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.03 
 
 
1299 aa  171  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.42 
 
 
1627 aa  164  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1536  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.14 
 
 
1568 aa  162  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.16 
 
 
1686 aa  157  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.09 
 
 
1590 aa  156  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.62 
 
 
1669 aa  144  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  24.92 
 
 
1014 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.26 
 
 
1122 aa  119  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.26 
 
 
1122 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  23.42 
 
 
991 aa  108  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  25 
 
 
1181 aa  103  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  24.79 
 
 
1581 aa  100  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  25.66 
 
 
1309 aa  99.8  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.5 
 
 
1223 aa  95.1  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  23.52 
 
 
1544 aa  90.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  24.57 
 
 
1200 aa  86.7  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  23.65 
 
 
1254 aa  84.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  24.92 
 
 
1470 aa  84.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  21.53 
 
 
1245 aa  83.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.12 
 
 
1115 aa  84  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.13 
 
 
1227 aa  79.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  21.63 
 
 
1169 aa  77.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  22.6 
 
 
1521 aa  76.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  23.14 
 
 
1521 aa  75.9  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  21.46 
 
 
1169 aa  74.3  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  26.73 
 
 
1327 aa  74.3  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  24.31 
 
 
1174 aa  73.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3188  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.27 
 
 
1154 aa  73.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444073  normal  0.594589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.15 
 
 
1500 aa  72.4  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  37.4 
 
 
1323 aa  72.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  25.62 
 
 
1182 aa  71.6  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.74 
 
 
1148 aa  71.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  23.08 
 
 
1225 aa  71.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  23.08 
 
 
1214 aa  71.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  23.3 
 
 
1545 aa  70.1  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  22.71 
 
 
1215 aa  69.3  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.95 
 
 
1723 aa  68.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.05 
 
 
1158 aa  68.6  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.23 
 
 
1722 aa  68.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  22.59 
 
 
1228 aa  68.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0627  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  28.21 
 
 
1722 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  28.14 
 
 
1378 aa  66.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  22.5 
 
 
1155 aa  66.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  28.14 
 
 
1378 aa  65.9  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  24.36 
 
 
1127 aa  65.9  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.13 
 
 
1517 aa  64.3  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0672  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.88 
 
 
1666 aa  64.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0705474  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  26.06 
 
 
1111 aa  63.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3149  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.73 
 
 
1717 aa  62  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.308905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  23.68 
 
 
1493 aa  61.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  23.48 
 
 
1273 aa  60.1  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2663  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  30.09 
 
 
1361 aa  59.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.98 
 
 
1287 aa  58.2  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0504  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.01 
 
 
1676 aa  56.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2539  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.56 
 
 
1205 aa  55.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  21.51 
 
 
1014 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0815  type IV pilus-associated protein, putative  21.72 
 
 
1067 aa  51.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  22.12 
 
 
1069 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.08 
 
 
1658 aa  51.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0358491  normal  0.103915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5191  FG-GAP repeat-containing protein  24.38 
 
 
798 aa  50.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163324  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1179  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.18 
 
 
1204 aa  49.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3129  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.2 
 
 
1168 aa  48.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.37 
 
 
1030 aa  48.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.11 
 
 
1577 aa  48.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  27.16 
 
 
1056 aa  46.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>