More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2645 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2645  OmpA/MotB  100 
 
 		 225 aa  457  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2312  OmpA/MotB  80.89 
 
 		 225 aa  367  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  34.88 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 560 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2703  OmpA domain-containing protein  41.9 
 
 		 560 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.74535  normal  0.0183644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1355  OmpA domain-containing protein  41.9 
 
 		 560 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 498 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 316 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4235  OmpA/MotB domain-containing protein  37.01 
 
 		 347 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 316 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.86 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  33.33 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  40.78 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  28.16 
 
 		 403 aa  65.5  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 320 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  40.2 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  41.9 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  32.03 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  40.35 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  39.81 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  30.41 
 
 		 525 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  39.81 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  37.14 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  39.81 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  39.81 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  39.81 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  39.81 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  37.38 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  33.98 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  39.81 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  39.81 
 
 		 402 aa  62.4  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  34.85 
 
 		 466 aa  62.4  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  39 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  39.81 
 
 		 310 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 		 537 aa  61.6  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  30.48 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  29.81 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  34.13 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  33.33 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  29.69 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  34.58 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  34.68 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  31.48 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  34.31 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  33.63 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  33.02 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 631 aa  59.3  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  36.28 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  33.07 
 
 		 466 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  36.27 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  36.27 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  36.54 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  32.54 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  33.96 
 
 		 417 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  36.27 
 
 		 415 aa  58.9  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  36.28 
 
 		 318 aa  58.5  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5086  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 533 aa  58.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  37.25 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  36.52 
 
 		 320 aa  58.5  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  33.58 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  34.95 
 
 		 364 aa  58.5  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  38.54 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  36.27 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0615  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  40.79 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  39.62 
 
 		 333 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  35.29 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  36.19 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  36.89 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  29.58 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2141  OmpA/MotB domain-containing protein  27.64 
 
 		 520 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0276844  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3934  OmpA/MotB domain protein  37.36 
 
 		 358 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000488148  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  31.4 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.54 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0873  OmpA/MotB domain protein  27.84 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  33.98 
 
 		 481 aa  56.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  31.71 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  32.77 
 
 		 445 aa  55.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1913  OmpA/MotB  36.89 
 
 		 363 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467087  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  32.35 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 463 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  38.24 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  31.85 
 
 		 466 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>