More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4235 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008765  Ajs_4235  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 347 aa  690    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2312  OmpA/MotB  37.72 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  35.77 
 
 		 221 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2645  OmpA/MotB  38.83 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  44.66 
 
 		 575 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  37.1 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  34.96 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  37.07 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1395  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.616253  normal  0.476019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  32.73 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  45.07 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6517  hypothetical protein  39.29 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4259  hypothetical protein  39.29 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00984605 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6620  hypothetical protein  39.29 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  43.06 
 
 		 260 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  43.06 
 
 		 260 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  40.74 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  45.07 
 
 		 221 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.91 
 
 		 609 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.93 
 
 		 217 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  41.33 
 
 		 216 aa  54.7  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  45.71 
 
 		 261 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  31.91 
 
 		 537 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  41 
 
 		 558 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  41 
 
 		 558 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  38.98 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  44.93 
 
 		 217 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 215 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 		 464 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  38.98 
 
 		 310 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  47.22 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.48 
 
 		 542 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  43.06 
 
 		 226 aa  53.9  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  41.98 
 
 		 768 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  31.79 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  32.69 
 
 		 242 aa  53.5  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 652 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  41.49 
 
 		 543 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  37.38 
 
 		 652 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  47.14 
 
 		 233 aa  53.5  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  41.41 
 
 		 542 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 263 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  41.75 
 
 		 572 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  41.11 
 
 		 261 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  46.48 
 
 		 544 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  41.11 
 
 		 261 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  33.07 
 
 		 478 aa  53.1  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 263 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  44.12 
 
 		 607 aa  52.8  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 263 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  42.03 
 
 		 217 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  45.71 
 
 		 642 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 262 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1676  hypothetical protein  38.78 
 
 		 217 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0861  OmpA/MotB domain-containing protein  30.08 
 
 		 230 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  40.58 
 
 		 221 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  31.45 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  40.58 
 
 		 221 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 525 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 217 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 193 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  29.06 
 
 		 631 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  29.55 
 
 		 710 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  35.64 
 
 		 237 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  39.44 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  40 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  41.43 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  43.06 
 
 		 230 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  30.83 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 487 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  40.85 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  39.74 
 
 		 223 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  34.58 
 
 		 205 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  31.13 
 
 		 510 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  36.71 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  36.52 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  36.56 
 
 		 195 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  41.98 
 
 		 576 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  27.6 
 
 		 456 aa  50.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  32.35 
 
 		 185 aa  50.4  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2703  OmpA domain-containing protein  32.26 
 
 		 560 aa  50.4  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.74535  normal  0.0183644 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.43 
 
 		 407 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  41.33 
 
 		 235 aa  50.8  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  37 
 
 		 464 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  29.2 
 
 		 1026 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 		 234 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 1755 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  39.73 
 
 		 374 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  43.42 
 
 		 342 aa  50.1  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  40.79 
 
 		 215 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  40.79 
 
 		 215 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  36.99 
 
 		 328 aa  50.1  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  39.19 
 
 		 218 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>