258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6620 on replicon NC_008385
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6517  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  281  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6620  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4259  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  281  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00984605 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6338  hypothetical protein  40.37 
 
 		 185 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.258634 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1676  hypothetical protein  40.74 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0861  OmpA/MotB domain-containing protein  38.27 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.11 
 
 		 607 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  42.47 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 242 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  35.53 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  35.53 
 
 		 210 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 		 219 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  40.58 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  35.53 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  35.53 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4235  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0058  putative lipoprotein  32.11 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  41.1 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  35.79 
 
 		 648 aa  55.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.21 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  39.24 
 
 		 334 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0053  putative lipoprotein  31.19 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  34.02 
 
 		 320 aa  54.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  35.53 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  31.86 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  43.48 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  35.21 
 
 		 237 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 243 aa  53.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  40.85 
 
 		 224 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  31.86 
 
 		 217 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  40.85 
 
 		 224 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  36 
 
 		 221 aa  52  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  35.96 
 
 		 533 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  39.44 
 
 		 205 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  31.11 
 
 		 220 aa  51.6  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  31.11 
 
 		 243 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  39.44 
 
 		 227 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  38.03 
 
 		 220 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 227 aa  51.2  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  35.06 
 
 		 324 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  34.31 
 
 		 218 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  38.36 
 
 		 330 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  34.83 
 
 		 533 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  40.85 
 
 		 216 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  40.85 
 
 		 216 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  33.01 
 
 		 206 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1745  OmpA domain-containing protein  33.02 
 
 		 524 aa  50.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  34.09 
 
 		 478 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  27.62 
 
 		 225 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2141  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 		 520 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0276844  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 224 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 231 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  33.68 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 218 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  37.68 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  39.44 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  34.65 
 
 		 220 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  30.19 
 
 		 523 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  38.81 
 
 		 367 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0781  OmpA domain-containing protein  32.65 
 
 		 573 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.04 
 
 		 248 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  33.98 
 
 		 294 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  32.04 
 
 		 206 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  28.21 
 
 		 631 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2246  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 407 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14079  decreased coverage  0.00792288 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 		 236 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  29.17 
 
 		 260 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000447727  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  34.21 
 
 		 230 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  36.54 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  38.16 
 
 		 230 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  33.33 
 
 		 235 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  36.17 
 
 		 248 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  31.48 
 
 		 321 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 366 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2645  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  30 
 
 		 402 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  37.5 
 
 		 366 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.98 
 
 		 220 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  34.78 
 
 		 352 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 		 239 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  32.38 
 
 		 216 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  28.85 
 
 		 217 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  34.18 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  35.37 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  31.51 
 
 		 264 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  25 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  34.33 
 
 		 333 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  29.52 
 
 		 542 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.35 
 
 		 217 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  29.41 
 
 		 407 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  36.99 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>