129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0849 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  47.44 
 
 		 1381 aa  1217    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  44.9 
 
 		 1441 aa  1132    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  52.25 
 
 		 1378 aa  1330    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  53.55 
 
 		 1425 aa  1353    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  47.92 
 
 		 1379 aa  1202    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  51.59 
 
 		 1418 aa  925    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  49.82 
 
 		 1420 aa  1234    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  41.33 
 
 		 1472 aa  911    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  100 
 
 		 1384 aa  2763    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  33.58 
 
 		 1450 aa  643    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  46.49 
 
 		 1394 aa  1105    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  32.55 
 
 		 1398 aa  609  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1426 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  31.45 
 
 		 1426 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  31.92 
 
 		 1419 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  31.74 
 
 		 1426 aa  569  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1419 aa  538  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1399 aa  531  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  29.74 
 
 		 1430 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1399 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1398 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  28.53 
 
 		 1428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1307 aa  513  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1398 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1399 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1399 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1399 aa  506  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  30.31 
 
 		 1397 aa  502  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  29.99 
 
 		 1397 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1368 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  29.99 
 
 		 1397 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1397 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1397 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  29.99 
 
 		 1397 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1372 aa  499  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1284 aa  493  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1341 aa  473  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1264 aa  416  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  28.47 
 
 		 1261 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  24.64 
 
 		 1384 aa  379  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  23.07 
 
 		 1379 aa  311  8e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  27.54 
 
 		 1304 aa  272  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1269 aa  260  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1271 aa  235  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1273 aa  234  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1273 aa  234  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1273 aa  233  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1271 aa  232  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1271 aa  225  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1288 aa  224  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1267 aa  221  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1271 aa  218  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  22.39 
 
 		 1301 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1276 aa  211  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  23.53 
 
 		 1346 aa  210  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1284 aa  209  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1291 aa  208  7e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1266 aa  204  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1276 aa  204  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1276 aa  201  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  21.87 
 
 		 1287 aa  196  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1277 aa  196  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1277 aa  195  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  22.23 
 
 		 1275 aa  194  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  21.6 
 
 		 1439 aa  194  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  23.07 
 
 		 1301 aa  194  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1305 aa  193  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  24.62 
 
 		 1300 aa  193  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1306 aa  193  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1265 aa  192  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1265 aa  192  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1266 aa  192  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1266 aa  191  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1266 aa  191  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  22.04 
 
 		 1416 aa  191  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1266 aa  191  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1266 aa  191  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  21.41 
 
 		 1383 aa  190  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  21.67 
 
 		 1454 aa  189  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1419 aa  188  6e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1459 aa  188  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1441 aa  188  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1307 aa  186  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1307 aa  186  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  21.65 
 
 		 1446 aa  185  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  21.99 
 
 		 1417 aa  183  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1274 aa  181  9e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  23.86 
 
 		 1273 aa  179  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  21.34 
 
 		 1417 aa  179  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1286 aa  178  7e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1291 aa  177  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1266 aa  176  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  23.4 
 
 		 1266 aa  175  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  23.4 
 
 		 1266 aa  175  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1266 aa  175  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1266 aa  174  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1266 aa  174  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1392 aa  174  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  23.39 
 
 		 1266 aa  173  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  21.58 
 
 		 1390 aa  173  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>