More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4210 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4210  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 899 aa  1779    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3285  type II and III secretion system protein  61.17 
 
 		 734 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4170  type II and III secretion system protein  98.74 
 
 		 743 aa  1188    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4171  type IV pilus assembly protein  99.64 
 
 		 277 aa  552  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0319  type II and III secretion system protein  41.65 
 
 		 818 aa  429  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1609  type II and III secretion system protein  45.32 
 
 		 801 aa  420  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3689  type II and III secretion system protein  40.27 
 
 		 811 aa  413  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2450  general secretion pathway protein D  35.29 
 
 		 771 aa  310  5.9999999999999995e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.83284  hitchhiker  0.00310624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3286  type IV pilus assembly protein  42.18 
 
 		 256 aa  211  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08151  Type II secretory pathway, component PulD  28.21 
 
 		 575 aa  197  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000262251 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0320  type IV pilus assembly protein PilO  37.11 
 
 		 259 aa  140  8.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.932275  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27881  general (type II) secretion pathway protein D precursor  33.23 
 
 		 849 aa  140  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3688  type IV pilus assembly protein PilO  37.4 
 
 		 253 aa  134  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06961  Type II secretory pathway component PulD-like protein  26.62 
 
 		 572 aa  132  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1764  type IV pilus assembly protein PilO  35.59 
 
 		 242 aa  111  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2451  putative type IV pilus assembly protein PilO  37.08 
 
 		 264 aa  103  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.308571  hitchhiker  0.00131619 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1194  Type II secretory pathway component PulD-like  29.62 
 
 		 556 aa  99.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0931358  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1607  type IV pilus assembly protein PilO  29.44 
 
 		 264 aa  90.1  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  31.77 
 
 		 494 aa  82.4  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  22 
 
 		 657 aa  77.8  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  29.44 
 
 		 625 aa  77.8  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1439  type II secretion system protein D  29.61 
 
 		 656 aa  77.8  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0989759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  20.85 
 
 		 710 aa  77.8  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  24.15 
 
 		 780 aa  77  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  29.59 
 
 		 657 aa  77  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1043  type II and III secretion system protein  28.41 
 
 		 589 aa  76.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0150789  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0578  type II and III secretion system protein  28.72 
 
 		 527 aa  75.9  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000285943 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  29.17 
 
 		 602 aa  76.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  21.98 
 
 		 717 aa  73.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3096  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  30.43 
 
 		 577 aa  73.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  40.91 
 
 		 881 aa  73.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0707  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  26.06 
 
 		 423 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.848525  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02977  putative GSPD-related protein  31.28 
 
 		 754 aa  72.8  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  24.72 
 
 		 682 aa  72  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  31.1 
 
 		 520 aa  72  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  24.51 
 
 		 649 aa  72  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  20.58 
 
 		 718 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  51.72 
 
 		 721 aa  71.2  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  21 
 
 		 718 aa  71.2  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  30.64 
 
 		 667 aa  71.2  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  31.61 
 
 		 756 aa  71.2  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  27.17 
 
 		 422 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  22.34 
 
 		 703 aa  70.5  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.37 
 
 		 538 aa  70.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  28.89 
 
 		 635 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  30 
 
 		 690 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  25.83 
 
 		 554 aa  69.7  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  30 
 
 		 690 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  28.16 
 
 		 641 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  24.72 
 
 		 779 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  30 
 
 		 690 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  30 
 
 		 574 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  31.58 
 
 		 679 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  24.03 
 
 		 714 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  23.22 
 
 		 706 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  23.26 
 
 		 740 aa  69.3  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  27.98 
 
 		 689 aa  69.3  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  25.41 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0369  type II/III secretion system protein  29.05 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.117344  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002368  MSHA biogenesis protein MshL  26 
 
 		 530 aa  68.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  22.59 
 
 		 655 aa  68.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0749  type II and III secretion system protein  26.84 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  29.76 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  29.76 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0206  type IV pilus assembly protein PilQ  22.85 
 
 		 745 aa  68.6  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  28.9 
 
 		 507 aa  68.6  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  25.41 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  26.88 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  30.11 
 
 		 750 aa  68.6  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  28.65 
 
 		 681 aa  68.2  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  23.63 
 
 		 704 aa  68.2  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  24.38 
 
 		 703 aa  68.2  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  26.88 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  29.34 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  28.31 
 
 		 642 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  28.87 
 
 		 571 aa  67.8  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  27.87 
 
 		 752 aa  67.8  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  28.31 
 
 		 642 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  27.96 
 
 		 767 aa  67.8  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  30.72 
 
 		 478 aa  67.4  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  27.66 
 
 		 787 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  27.17 
 
 		 420 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  20.04 
 
 		 692 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  28.31 
 
 		 646 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3619  general secretion pathway protein D  24.09 
 
 		 707 aa  67  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  45.16 
 
 		 721 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  28.19 
 
 		 814 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3936  general secretion pathway protein D  28.49 
 
 		 791 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1929  type II and III secretion system protein  27.81 
 
 		 796 aa  67.4  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.114575  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  22.07 
 
 		 797 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  45.16 
 
 		 721 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  30.72 
 
 		 478 aa  67.4  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  24.07 
 
 		 710 aa  67  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  27.54 
 
 		 657 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  27.54 
 
 		 656 aa  67  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  27.85 
 
 		 829 aa  66.6  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003337  type III secretion system outer membrane pore YscC  30.94 
 
 		 604 aa  66.6  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  29.12 
 
 		 422 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  28.74 
 
 		 493 aa  66.6  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2306  general secretion pathway protein D  39.18 
 
 		 674 aa  66.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>