More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2002 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
560 aa  1163    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.22 
 
 
261 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.6 
 
 
279 aa  172  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.4 
 
 
290 aa  169  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.08 
 
 
273 aa  166  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.43 
 
 
274 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.53 
 
 
267 aa  163  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.28 
 
 
298 aa  162  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.86 
 
 
272 aa  157  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  39.83 
 
 
267 aa  156  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.2 
 
 
263 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.1 
 
 
249 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.89 
 
 
247 aa  152  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.89 
 
 
277 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.95 
 
 
268 aa  150  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.08 
 
 
278 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.08 
 
 
278 aa  150  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.51 
 
 
274 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
271 aa  147  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725302  normal  0.780103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 
278 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 
278 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.6 
 
 
277 aa  146  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 
278 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  35.83 
 
 
282 aa  144  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.19 
 
 
273 aa  144  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.75 
 
 
269 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2833  putative UDP-glucose 4-epimerase  40 
 
 
244 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36890  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.15 
 
 
273 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.578301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 
282 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.76 
 
 
278 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.188052  normal  0.482057 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.47 
 
 
281 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.47 
 
 
281 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
255 aa  140  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.8 
 
 
273 aa  140  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.12 
 
 
268 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  32.79 
 
 
275 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.71 
 
 
268 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.93 
 
 
283 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 
274 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.12 
 
 
268 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 
280 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  33.47 
 
 
275 aa  136  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
261 aa  136  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.18 
 
 
277 aa  136  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.71 
 
 
268 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132955  normal  0.0662114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.19 
 
 
275 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1807  hypothetical protein  32.91 
 
 
278 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0111312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.59 
 
 
269 aa  134  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.19 
 
 
274 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 
279 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 
249 aa  133  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.31 
 
 
272 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 
267 aa  130  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 
257 aa  128  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  decreased coverage  0.00160839 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
278 aa  126  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.69 
 
 
278 aa  126  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.62 
 
 
295 aa  126  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02700  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.71 
 
 
270 aa  124  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.262568  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3405  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 
265 aa  123  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3673  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
302 aa  123  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  35.32 
 
 
255 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
276 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512968 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 
252 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0483  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
278 aa  121  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00129402  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 
266 aa  120  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.69 
 
 
277 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479563  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0191  hypothetical protein  35.86 
 
 
311 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3497  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.76 
 
 
275 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 
256 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.05 
 
 
277 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000357423 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.2 
 
 
283 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00262717  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5445  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 
276 aa  113  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620195 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.07 
 
 
276 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 
256 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.243124  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1140  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.29 
 
 
252 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 
299 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
303 aa  98.2  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.31 
 
 
313 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  27.24 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.84 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 
297 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.69 
 
 
301 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
327 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.47 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 
296 aa  77  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
299 aa  77  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.73 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.38 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  26.91 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133207  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.32 
 
 
303 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>