66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0124 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  62.64 
 
 
642 aa  825    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  100 
 
 
641 aa  1303    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  47.43 
 
 
633 aa  531  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  35.12 
 
 
669 aa  319  9e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  32.24 
 
 
931 aa  287  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  25.52 
 
 
543 aa  71.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  34.75 
 
 
479 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  32.81 
 
 
448 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  24.36 
 
 
649 aa  64.3  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  25.08 
 
 
865 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  35.48 
 
 
470 aa  60.8  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 
475 aa  60.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  31.25 
 
 
1392 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 
446 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 
543 aa  58.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  28.81 
 
 
446 aa  57.8  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  29.55 
 
 
524 aa  57.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  37.5 
 
 
537 aa  57  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 
518 aa  57  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  28.06 
 
 
447 aa  57  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  27.44 
 
 
528 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  33.91 
 
 
560 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2672  hypothetical protein  31.25 
 
 
495 aa  56.2  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  31.76 
 
 
518 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  35.58 
 
 
455 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
491 aa  54.7  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4311  hypothetical protein  32.26 
 
 
1405 aa  54.7  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.861205  normal  0.589522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  29.86 
 
 
542 aa  54.3  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  29.1 
 
 
246 aa  53.9  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 
463 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  31.48 
 
 
530 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  25 
 
 
492 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  42.65 
 
 
559 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  26.16 
 
 
460 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  34.34 
 
 
522 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  22.76 
 
 
443 aa  53.5  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  30.63 
 
 
444 aa  53.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  33.05 
 
 
544 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  28.33 
 
 
554 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4312  hypothetical protein  34.92 
 
 
1413 aa  51.6  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319357  normal  0.568612 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  35.71 
 
 
431 aa  51.2  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 
460 aa  50.8  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  31.85 
 
 
460 aa  50.8  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  25.82 
 
 
467 aa  50.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  36.67 
 
 
606 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  37.39 
 
 
462 aa  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0441  hypothetical protein  28.68 
 
 
814 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  24.72 
 
 
416 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  25.33 
 
 
454 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 
474 aa  49.7  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  25.12 
 
 
521 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  29.23 
 
 
496 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  26.62 
 
 
489 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  22.98 
 
 
390 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  29.91 
 
 
604 aa  48.9  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  23.91 
 
 
442 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  30.36 
 
 
551 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  39.76 
 
 
702 aa  47  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  27.27 
 
 
665 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  37.66 
 
 
509 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  24.91 
 
 
444 aa  45.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  29.92 
 
 
983 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.45 
 
 
491 aa  44.7  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  41.11 
 
 
916 aa  44.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0412  hypothetical protein  30.08 
 
 
372 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  27.97 
 
 
509 aa  43.9  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>