More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1415 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  100 
 
 		 286 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  46.69 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  43.01 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  44.13 
 
 		 284 aa  259  4e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  44.8 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.76 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  43.62 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  45.2 
 
 		 282 aa  249  5e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.11 
 
 		 299 aa  245  4.9999999999999997e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  44.29 
 
 		 295 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  43.32 
 
 		 289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  44.88 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 		 290 aa  225  8e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  37.54 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  42.66 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  38.3 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  39.31 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  36.71 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  37.98 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  38.41 
 
 		 307 aa  198  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  35.56 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  37.37 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  36.84 
 
 		 292 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  36.84 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  36.59 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  36.84 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  36.49 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  36.49 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  36.36 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  34.38 
 
 		 288 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  37.71 
 
 		 298 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  34.03 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  37.1 
 
 		 369 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  33.56 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 308 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 336 aa  175  7e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  34.72 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  34.42 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  41.71 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  37.93 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  38.84 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  32.89 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  32.69 
 
 		 315 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  33.22 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  34.89 
 
 		 309 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  40.1 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  39.37 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  35.14 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 301 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  38.18 
 
 		 236 aa  165  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1746  ABC transporter-related protein  39.37 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.5 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  38.6 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  34.45 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  38.6 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  36.28 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  40.67 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  36.68 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  37.61 
 
 		 311 aa  162  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  35.59 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  34.36 
 
 		 308 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21580  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.79 
 
 		 244 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  37.73 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  35.48 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  32.05 
 
 		 360 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  30.3 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  39.27 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0621  ABC transporter related  41.21 
 
 		 246 aa  159  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.958584  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  32.77 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 		 314 aa  158  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  33.77 
 
 		 311 aa  158  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  34.7 
 
 		 306 aa  158  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2113  ABC transporter related  39.73 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  35.94 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  32.7 
 
 		 331 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  35.29 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  38.5 
 
 		 309 aa  157  1e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.04 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.451187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  36.07 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  37.79 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  35.81 
 
 		 337 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  37.79 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.1 
 
 		 301 aa  156  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.62 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  31.41 
 
 		 328 aa  156  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  38.53 
 
 		 311 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.36 
 
 		 316 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  35.5 
 
 		 316 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  35.43 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  36.36 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  36.44 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  32.11 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  33.58 
 
 		 309 aa  155  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  32.22 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  39.01 
 
 		 318 aa  155  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>