203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4713 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4713  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 393 aa  823    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317853  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1880  Radical SAM domain protein  62.6 
 
 		 397 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  48.24 
 
 		 388 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  47.97 
 
 		 388 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  47.91 
 
 		 388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  47.91 
 
 		 387 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  44.48 
 
 		 373 aa  329  6e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  46.8 
 
 		 359 aa  329  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  44.44 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  44.89 
 
 		 386 aa  327  3e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  45.18 
 
 		 360 aa  322  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  44.41 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  43.92 
 
 		 361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  45.17 
 
 		 367 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  43.61 
 
 		 358 aa  319  6e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  44.13 
 
 		 367 aa  315  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  43.53 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  42.47 
 
 		 376 aa  310  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  42.66 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  43.68 
 
 		 380 aa  305  7e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  43.09 
 
 		 372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  42.06 
 
 		 359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  41.18 
 
 		 396 aa  301  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  41.94 
 
 		 391 aa  300  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  41.6 
 
 		 367 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  42.74 
 
 		 373 aa  299  6e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  39.39 
 
 		 359 aa  299  6e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  42.27 
 
 		 387 aa  299  7e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  41.11 
 
 		 367 aa  297  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  40.71 
 
 		 368 aa  294  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  41.97 
 
 		 362 aa  292  8e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  39.06 
 
 		 364 aa  290  2e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  41.69 
 
 		 353 aa  291  2e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  41.64 
 
 		 350 aa  290  3e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  41.85 
 
 		 353 aa  290  4e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  41 
 
 		 371 aa  287  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  42.74 
 
 		 354 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  40.22 
 
 		 354 aa  286  5.999999999999999e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  41.97 
 
 		 353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  40.76 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  41.23 
 
 		 354 aa  280  2e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4505  radical SAM domain-containing protein  39.95 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.325974  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  42.22 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  41.39 
 
 		 354 aa  278  9e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4085  radical SAM domain-containing protein  39.68 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.181055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  40.05 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  40.22 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6111  radical SAM domain-containing protein  39.3 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  38.57 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0587  Radical SAM domain-containing protein  38.08 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  39.11 
 
 		 358 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  38.95 
 
 		 365 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  36.91 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0710  hypothetical protein  37.5 
 
 		 369 aa  237  2e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  33.99 
 
 		 360 aa  236  7e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  36.69 
 
 		 363 aa  229  5e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  36.36 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  34.97 
 
 		 350 aa  227  3e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  36.44 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  36.26 
 
 		 355 aa  225  9e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  34.73 
 
 		 356 aa  225  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  36.03 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  34.83 
 
 		 358 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  34.64 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  35.55 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  33.71 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  33.43 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  33.73 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  34.54 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  32.95 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1417  radical SAM domain-containing protein  33.43 
 
 		 364 aa  210  4e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  33.99 
 
 		 384 aa  209  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  34.19 
 
 		 359 aa  209  9e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  32.35 
 
 		 429 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  34.06 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  33.96 
 
 		 435 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  34.83 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  32.68 
 
 		 367 aa  206  7e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  35.06 
 
 		 348 aa  206  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  35.73 
 
 		 348 aa  205  9e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 		 385 aa  205  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  35.55 
 
 		 348 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  32.6 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  33.78 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  34.22 
 
 		 353 aa  203  4e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 625 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  32.86 
 
 		 376 aa  203  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  33.7 
 
 		 356 aa  203  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  33.6 
 
 		 375 aa  202  8e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  33.53 
 
 		 364 aa  202  9e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  35.26 
 
 		 348 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  32.72 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  35.26 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  34.73 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  31.13 
 
 		 357 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  32.5 
 
 		 355 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  30.18 
 
 		 419 aa  199  5e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  32.32 
 
 		 366 aa  199  6e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  33.14 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>